More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1146 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  54.1 
 
 		 1075 aa  1136    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  41.45 
 
 		 1064 aa  783    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  52.34 
 
 		 1075 aa  1104    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1065 aa  676    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  46.47 
 
 		 1077 aa  1006    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  47.3 
 
 		 1081 aa  970    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  47.64 
 
 		 1089 aa  974    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  41.58 
 
 		 1065 aa  795    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  40.78 
 
 		 1112 aa  788    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  45.44 
 
 		 1067 aa  910    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  47.92 
 
 		 696 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  50.82 
 
 		 1078 aa  1066    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  41.94 
 
 		 1071 aa  781    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  48.13 
 
 		 1083 aa  996    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  53.6 
 
 		 1090 aa  1207    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  41.11 
 
 		 1069 aa  778    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.33 
 
 		 1085 aa  942    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  100 
 
 		 1082 aa  2209    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  40.51 
 
 		 1077 aa  808    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  50.87 
 
 		 1074 aa  1064    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  39.59 
 
 		 1053 aa  687    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  40.78 
 
 		 1072 aa  803    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  54.08 
 
 		 1087 aa  1198    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  40.71 
 
 		 1078 aa  789    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  40.07 
 
 		 1077 aa  757    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  53.42 
 
 		 1075 aa  1150    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  25.74 
 
 		 1016 aa  231  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  24.66 
 
 		 1124 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  28.25 
 
 		 1128 aa  214  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  24.64 
 
 		 1131 aa  207  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  28.49 
 
 		 1153 aa  205  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  28.46 
 
 		 1109 aa  194  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  29.34 
 
 		 1052 aa  180  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.87 
 
 		 1143 aa  179  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.28 
 
 		 1100 aa  178  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  24.72 
 
 		 853 aa  173  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  27.93 
 
 		 1086 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  24.82 
 
 		 1086 aa  166  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.9 
 
 		 1051 aa  164  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.56 
 
 		 1080 aa  162  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  27.17 
 
 		 1099 aa  154  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.63 
 
 		 1109 aa  154  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.62 
 
 		 1125 aa  153  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 		 1122 aa  148  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  25 
 
 		 1127 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  25.07 
 
 		 1160 aa  139  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  24.41 
 
 		 1086 aa  137  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.61 
 
 		 1117 aa  137  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  26.71 
 
 		 1153 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  42 
 
 		 1140 aa  112  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1170 aa  101  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  24.96 
 
 		 942 aa  98.2  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  23.25 
 
 		 964 aa  94  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  24.02 
 
 		 949 aa  90.9  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.94 
 
 		 1060 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  31.87 
 
 		 1170 aa  85.9  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  23.41 
 
 		 915 aa  85.9  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  24.92 
 
 		 969 aa  84  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.16 
 
 		 952 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  31.37 
 
 		 1169 aa  82.8  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  29.52 
 
 		 1065 aa  82.8  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31.86 
 
 		 1169 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  29.24 
 
 		 1065 aa  82  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  29.24 
 
 		 1065 aa  82  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  30.51 
 
 		 760 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 1172 aa  80.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  25.83 
 
 		 1187 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.24 
 
 		 933 aa  79  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.39 
 
 		 1170 aa  79  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  31.05 
 
 		 906 aa  79  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.71 
 
 		 1212 aa  78.2  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  32.09 
 
 		 813 aa  78.2  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  33.55 
 
 		 966 aa  77.8  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  33.33 
 
 		 774 aa  77.8  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  30.68 
 
 		 1172 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  24.07 
 
 		 919 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  26.4 
 
 		 946 aa  75.5  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.96 
 
 		 1160 aa  75.1  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.2 
 
 		 988 aa  75.1  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 1177 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.41 
 
 		 1160 aa  73.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  27.06 
 
 		 840 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  37.11 
 
 		 972 aa  73.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  26.21 
 
 		 1043 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.76 
 
 		 835 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 		 953 aa  72.8  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1144 aa  72.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  26.16 
 
 		 1129 aa  72.4  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  31.79 
 
 		 1168 aa  72  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  28.57 
 
 		 910 aa  71.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  28.44 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.68 
 
 		 986 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  26.53 
 
 		 819 aa  70.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  30.51 
 
 		 975 aa  71.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  31.76 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  25.34 
 
 		 945 aa  70.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.5 
 
 		 949 aa  70.1  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  32.31 
 
 		 1194 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  26.65 
 
 		 941 aa  70.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  32 
 
 		 929 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>