More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0157 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  39.02 
 
 
1075 aa  788    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  73.31 
 
 
1065 aa  1611    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  47.61 
 
 
1083 aa  1080    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  36.52 
 
 
1053 aa  661    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  40.66 
 
 
1078 aa  738    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  46.45 
 
 
1081 aa  983    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  82.77 
 
 
1069 aa  1813    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  47.89 
 
 
1089 aa  995    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  51.67 
 
 
1067 aa  1145    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  36.19 
 
 
1065 aa  656    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  78.25 
 
 
1077 aa  1706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  38.36 
 
 
1112 aa  728    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  65.92 
 
 
1071 aa  1406    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  40.71 
 
 
1082 aa  789    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  42.38 
 
 
1090 aa  843    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  40.89 
 
 
1075 aa  835    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.41 
 
 
1085 aa  991    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  39.85 
 
 
1077 aa  738    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  61.87 
 
 
1077 aa  1353    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  72.47 
 
 
1072 aa  1610    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  41.13 
 
 
1074 aa  798    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  72.18 
 
 
1064 aa  1561    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  39.62 
 
 
1087 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1078 aa  2203    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  40.07 
 
 
1075 aa  788    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  38.62 
 
 
696 aa  466  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.91 
 
 
1131 aa  238  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.92 
 
 
1124 aa  219  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 
1143 aa  217  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.17 
 
 
1016 aa  210  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 
1128 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.9 
 
 
1153 aa  193  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  27.23 
 
 
1086 aa  170  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  24.87 
 
 
1051 aa  169  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.86 
 
 
853 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
1100 aa  165  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  25.6 
 
 
1052 aa  157  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  25.06 
 
 
1109 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  25.24 
 
 
1086 aa  142  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.66 
 
 
1127 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.4 
 
 
1080 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.53 
 
 
1099 aa  138  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.23 
 
 
1060 aa  135  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.41 
 
 
1086 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.57 
 
 
1109 aa  131  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  24.35 
 
 
1122 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  22.51 
 
 
1117 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.35 
 
 
1125 aa  111  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  39.74 
 
 
1140 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  22.7 
 
 
1160 aa  99.8  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  32.02 
 
 
1153 aa  97.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.62 
 
 
1170 aa  85.5  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  24.84 
 
 
1187 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.96 
 
 
952 aa  84  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 
1147 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.4 
 
 
966 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  26.3 
 
 
1065 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  32.97 
 
 
933 aa  79.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  22.6 
 
 
915 aa  79.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28 
 
 
933 aa  78.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  31.65 
 
 
1043 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.33 
 
 
1065 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.33 
 
 
1065 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.79 
 
 
1160 aa  75.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  31.53 
 
 
910 aa  75.5  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.75 
 
 
972 aa  75.5  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  33.33 
 
 
946 aa  75.1  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 
940 aa  75.1  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.42 
 
 
969 aa  73.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.2 
 
 
969 aa  72.4  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  32.32 
 
 
819 aa  72.8  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  23.6 
 
 
962 aa  72.4  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.77 
 
 
941 aa  72  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  28.65 
 
 
760 aa  72  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31.45 
 
 
1169 aa  72  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.77 
 
 
941 aa  72  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  30.59 
 
 
541 aa  71.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  30.19 
 
 
1136 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.12 
 
 
1169 aa  71.2  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.58 
 
 
1172 aa  71.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  33.7 
 
 
950 aa  70.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  33.33 
 
 
1037 aa  70.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
1013 aa  70.1  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  35.38 
 
 
948 aa  70.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  33.95 
 
 
584 aa  69.7  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.83 
 
 
1170 aa  68.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.88 
 
 
1172 aa  68.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  31.4 
 
 
968 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
964 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  28.49 
 
 
669 aa  68.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.01 
 
 
1138 aa  68.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  34.85 
 
 
1160 aa  68.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.12 
 
 
829 aa  68.2  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.24 
 
 
835 aa  68.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.27 
 
 
988 aa  67.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.24 
 
 
1144 aa  67.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  30.85 
 
 
971 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  32.82 
 
 
1168 aa  67  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 
1137 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  26.74 
 
 
584 aa  67  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>