More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1670 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  42.28 
 
 		 1125 aa  813    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  48.1 
 
 		 1122 aa  967    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  100 
 
 		 1109 aa  2230    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  35.44 
 
 		 1052 aa  463  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  31.96 
 
 		 1051 aa  437  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  33.4 
 
 		 1086 aa  433  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  31.69 
 
 		 1086 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  30.89 
 
 		 1080 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  28.31 
 
 		 1117 aa  335  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  27.5 
 
 		 1127 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  29.03 
 
 		 1099 aa  308  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.93 
 
 		 1160 aa  237  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  24.93 
 
 		 1128 aa  224  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  24.98 
 
 		 1140 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  23.94 
 
 		 1124 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.31 
 
 		 1100 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  25.78 
 
 		 853 aa  165  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.13 
 
 		 1143 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  26.04 
 
 		 1082 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 1131 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.43 
 
 		 1065 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  24.25 
 
 		 1086 aa  147  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.19 
 
 		 1085 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.29 
 
 		 1067 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25.89 
 
 		 1083 aa  139  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  25.4 
 
 		 1074 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  26.07 
 
 		 1053 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  24.69 
 
 		 1087 aa  137  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  25.58 
 
 		 1090 aa  136  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  25.06 
 
 		 1089 aa  136  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  26.01 
 
 		 1075 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 1075 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  25.64 
 
 		 1081 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  24.57 
 
 		 1078 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1065 aa  128  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  24.94 
 
 		 1075 aa  127  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  23.49 
 
 		 1078 aa  126  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  24.07 
 
 		 1069 aa  123  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  33.22 
 
 		 1153 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 1016 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  23.96 
 
 		 1072 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  23.79 
 
 		 1065 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  24.65 
 
 		 1077 aa  116  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.01 
 
 		 1153 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 		 1109 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  22.45 
 
 		 1077 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  24.96 
 
 		 1071 aa  109  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  24.27 
 
 		 1077 aa  108  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  30.41 
 
 		 1112 aa  104  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  22.7 
 
 		 916 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  22.7 
 
 		 915 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  22.4 
 
 		 915 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  23.14 
 
 		 921 aa  98.6  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  26.68 
 
 		 1064 aa  97.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  23.54 
 
 		 1065 aa  96.3  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  23.54 
 
 		 1065 aa  96.3  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  20 
 
 		 1060 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  40 
 
 		 1062 aa  91.7  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  36 
 
 		 1131 aa  89.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  32.94 
 
 		 1172 aa  89  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 1170 aa  86.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.66 
 
 		 962 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  25.44 
 
 		 964 aa  85.5  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  36.24 
 
 		 923 aa  85.5  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  34.39 
 
 		 1194 aa  85.1  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  28.41 
 
 		 1037 aa  85.1  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  22.1 
 
 		 958 aa  85.1  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  42.86 
 
 		 774 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.61 
 
 		 919 aa  84  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  22.94 
 
 		 958 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.98 
 
 		 972 aa  83.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  34.03 
 
 		 968 aa  82.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.62 
 
 		 967 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  32.61 
 
 		 889 aa  82  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  30.81 
 
 		 1043 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 948 aa  81.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  26.18 
 
 		 1167 aa  81.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.11 
 
 		 1160 aa  81.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  27.51 
 
 		 963 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.98 
 
 		 988 aa  80.9  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.36 
 
 		 1145 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  25.09 
 
 		 1167 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  28.44 
 
 		 1187 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.26 
 
 		 1168 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.44 
 
 		 1170 aa  80.1  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.18 
 
 		 966 aa  79.7  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  25.48 
 
 		 1049 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.86 
 
 		 584 aa  79.7  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.93 
 
 		 1169 aa  79.7  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 		 1046 aa  79.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.56 
 
 		 1170 aa  79  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  31.61 
 
 		 924 aa  79  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 942 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  24.92 
 
 		 915 aa  78.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  33.56 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  37.01 
 
 		 1136 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  32.58 
 
 		 922 aa  78.2  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 		 1169 aa  78.2  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  37.14 
 
 		 805 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  29.69 
 
 		 1170 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>