More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3414 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  100 
 
 		 1127 aa  2327    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  38.98 
 
 		 1099 aa  761    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  34.39 
 
 		 1052 aa  544  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  34.3 
 
 		 1086 aa  522  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  34.01 
 
 		 1080 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  33.78 
 
 		 1051 aa  513  1e-144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  33.64 
 
 		 1086 aa  493  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  34.32 
 
 		 1160 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 1122 aa  336  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  29.41 
 
 		 1125 aa  330  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  27.63 
 
 		 1109 aa  320  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  28.89 
 
 		 1117 aa  304  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  25.63 
 
 		 1016 aa  242  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.86 
 
 		 1124 aa  239  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.35 
 
 		 1143 aa  211  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.11 
 
 		 1100 aa  211  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.93 
 
 		 1086 aa  207  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  24.87 
 
 		 1128 aa  205  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.12 
 
 		 1153 aa  202  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  24.24 
 
 		 1131 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.31 
 
 		 853 aa  194  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  24.9 
 
 		 1109 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  25.38 
 
 		 1140 aa  184  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  25.15 
 
 		 1075 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  24.81 
 
 		 1153 aa  174  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24 
 
 		 1085 aa  170  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  24.19 
 
 		 1112 aa  169  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.23 
 
 		 1067 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  23.64 
 
 		 1083 aa  167  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  25.1 
 
 		 1074 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  23.62 
 
 		 1081 aa  162  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  24.38 
 
 		 1075 aa  161  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  23.6 
 
 		 1071 aa  158  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  23.62 
 
 		 1089 aa  154  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  22.25 
 
 		 1053 aa  153  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  24.81 
 
 		 1077 aa  152  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.01 
 
 		 1065 aa  151  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  23.74 
 
 		 1090 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  23.67 
 
 		 1078 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  25.27 
 
 		 1082 aa  149  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  24.35 
 
 		 1077 aa  148  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  23.69 
 
 		 1078 aa  142  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  22.92 
 
 		 1072 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  23.35 
 
 		 1075 aa  139  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  23.03 
 
 		 1087 aa  138  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  23.33 
 
 		 1077 aa  137  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  23.15 
 
 		 1065 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1065 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  24.11 
 
 		 1064 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  22.74 
 
 		 1069 aa  122  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  23.39 
 
 		 1129 aa  106  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  24.62 
 
 		 1147 aa  100  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  23.42 
 
 		 1145 aa  99.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  24.08 
 
 		 1170 aa  96.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  22.36 
 
 		 1046 aa  95.9  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  25.3 
 
 		 1201 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  25.3 
 
 		 1201 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.49 
 
 		 1138 aa  92.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  34.05 
 
 		 1037 aa  92  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.61 
 
 		 1060 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  22.94 
 
 		 1167 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  24.7 
 
 		 1165 aa  84.7  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  28.09 
 
 		 1172 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  21.55 
 
 		 696 aa  82.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  32.54 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  29.61 
 
 		 1170 aa  82  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.67 
 
 		 1168 aa  81.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.24 
 
 		 1082 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.65 
 
 		 1172 aa  80.9  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  28.09 
 
 		 1194 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  29.19 
 
 		 1043 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 964 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 1170 aa  78.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.49 
 
 		 1212 aa  78.2  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  27.85 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 906 aa  78.2  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.01 
 
 		 1160 aa  77.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.72 
 
 		 1170 aa  77.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.03 
 
 		 961 aa  77  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  20.02 
 
 		 915 aa  77  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  23.41 
 
 		 1062 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  24.32 
 
 		 724 aa  75.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  24.68 
 
 		 1187 aa  75.5  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  22.97 
 
 		 1177 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  30.07 
 
 		 774 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  23.83 
 
 		 1065 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  23.83 
 
 		 1065 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 665 aa  73.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.4 
 
 		 967 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 923 aa  73.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  34.78 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  31.16 
 
 		 963 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.03 
 
 		 1169 aa  72.4  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  22.01 
 
 		 971 aa  72.4  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.24 
 
 		 1062 aa  72.4  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 1136 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 1167 aa  72.4  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  22.37 
 
 		 1088 aa  72  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.28 
 
 		 877 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 1169 aa  71.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>