More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2177 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  45.74 
 
 
1075 aa  907    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  53.88 
 
 
1089 aa  1175    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  47.04 
 
 
1077 aa  974    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  41.26 
 
 
1053 aa  740    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  47.13 
 
 
1065 aa  992    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  40.84 
 
 
1065 aa  754    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  46.7 
 
 
1074 aa  931    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  47.51 
 
 
1069 aa  983    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  52.32 
 
 
1067 aa  1136    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  44.18 
 
 
1077 aa  884    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  48.24 
 
 
1071 aa  1002    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  47.3 
 
 
1082 aa  970    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  46.67 
 
 
1090 aa  959    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  45.67 
 
 
1075 aa  910    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  100 
 
 
1081 aa  2236    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.34 
 
 
1085 aa  1122    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  45.06 
 
 
1112 aa  916    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  49.45 
 
 
1077 aa  1024    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  48.29 
 
 
1072 aa  1012    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  44.2 
 
 
1078 aa  856    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  45.71 
 
 
1064 aa  939    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  55.29 
 
 
1083 aa  1224    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  45.31 
 
 
1087 aa  937    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  46.45 
 
 
1078 aa  983    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  45.93 
 
 
1075 aa  948    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  45.43 
 
 
696 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
1016 aa  256  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  24.68 
 
 
1124 aa  235  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  25.88 
 
 
1131 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  26.82 
 
 
1128 aa  205  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  24.73 
 
 
1153 aa  198  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.56 
 
 
1143 aa  193  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.81 
 
 
1086 aa  192  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  25.68 
 
 
1051 aa  178  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  25.24 
 
 
1052 aa  179  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 
1109 aa  177  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.65 
 
 
1086 aa  166  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.29 
 
 
1100 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  25.84 
 
 
1117 aa  159  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  24.2 
 
 
853 aa  158  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.61 
 
 
1127 aa  156  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  23.86 
 
 
1099 aa  146  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.33 
 
 
1080 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  25.54 
 
 
1160 aa  142  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.32 
 
 
1086 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.48 
 
 
1125 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.3 
 
 
1109 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  24.59 
 
 
1122 aa  125  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  23.72 
 
 
1065 aa  125  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  41.98 
 
 
1140 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  37 
 
 
1153 aa  105  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  23.03 
 
 
969 aa  98.6  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  22.02 
 
 
1046 aa  99  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  25.21 
 
 
1147 aa  97.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  24.1 
 
 
933 aa  95.1  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  24.43 
 
 
962 aa  94.7  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  23.79 
 
 
952 aa  95.1  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.46 
 
 
1187 aa  91.7  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.68 
 
 
835 aa  89.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.68 
 
 
1144 aa  89.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  22.98 
 
 
1129 aa  88.2  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  24.13 
 
 
966 aa  83.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  22.83 
 
 
1060 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  30.39 
 
 
1043 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  36.57 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  36.57 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  35.29 
 
 
972 aa  79.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30 
 
 
1138 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  36.57 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  35.54 
 
 
560 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
813 aa  77.4  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  21.36 
 
 
915 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  28.84 
 
 
1013 aa  76.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.57 
 
 
919 aa  76.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  31.34 
 
 
1169 aa  75.1  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  32.62 
 
 
1170 aa  74.7  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  34.27 
 
 
1037 aa  74.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  30.56 
 
 
933 aa  73.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
964 aa  74.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
947 aa  73.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  42.5 
 
 
584 aa  73.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.3 
 
 
1169 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.11 
 
 
1065 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.11 
 
 
1065 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  37.04 
 
 
1168 aa  72.8  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  31.87 
 
 
1116 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  31.84 
 
 
760 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  33.12 
 
 
1172 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.55 
 
 
988 aa  72.4  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
1172 aa  72  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  30.86 
 
 
1131 aa  72  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.82 
 
 
1145 aa  72  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  35.56 
 
 
942 aa  72  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>