More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4501 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  100 
 
 
1086 aa  2231    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  63.91 
 
 
1100 aa  1461    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  65.95 
 
 
853 aa  1155    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  36.77 
 
 
1128 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  37.89 
 
 
1140 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  36.62 
 
 
1109 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  36.01 
 
 
1153 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5514  hypothetical protein  56.59 
 
 
206 aa  249  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286537  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.25 
 
 
1080 aa  240  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 
1016 aa  236  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.49 
 
 
1131 aa  227  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.71 
 
 
1085 aa  223  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  25.33 
 
 
1052 aa  206  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  25.92 
 
 
1124 aa  201  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.93 
 
 
1086 aa  195  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.4 
 
 
1051 aa  192  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  27.15 
 
 
1075 aa  178  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  26.54 
 
 
1143 aa  177  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  26.55 
 
 
1075 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  27.87 
 
 
1077 aa  172  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  25.57 
 
 
1112 aa  170  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  26.19 
 
 
1077 aa  171  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  27.23 
 
 
1078 aa  170  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  27.69 
 
 
1071 aa  170  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.52 
 
 
1086 aa  168  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  24.82 
 
 
1082 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  25.65 
 
 
1081 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  27.37 
 
 
1072 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 
1075 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  26.24 
 
 
1077 aa  163  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  23.79 
 
 
1083 aa  162  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  27.46 
 
 
1069 aa  160  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.33 
 
 
1109 aa  157  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.13 
 
 
1160 aa  155  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.2 
 
 
1065 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  22.39 
 
 
1117 aa  154  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  25.86 
 
 
1078 aa  152  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.79 
 
 
1067 aa  151  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  27.22 
 
 
1090 aa  150  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  24.8 
 
 
1089 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  26.29 
 
 
1065 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  25.64 
 
 
1064 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  25.62 
 
 
1074 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  24.9 
 
 
1087 aa  140  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  29.5 
 
 
1127 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.32 
 
 
1153 aa  129  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  36.73 
 
 
1037 aa  102  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  27.44 
 
 
1099 aa  102  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  37.36 
 
 
1053 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32 
 
 
1147 aa  100  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  23.32 
 
 
1065 aa  100  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  26.79 
 
 
1060 aa  98.6  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  29.02 
 
 
1125 aa  97.8  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  23.64 
 
 
1046 aa  97.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  24.88 
 
 
1129 aa  95.9  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  26.36 
 
 
966 aa  94.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.43 
 
 
1172 aa  93.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 
1170 aa  92.8  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  25.14 
 
 
1116 aa  92.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  25.45 
 
 
1160 aa  90.1  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  38.1 
 
 
813 aa  89.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  26.04 
 
 
696 aa  87.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  29.64 
 
 
1043 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  30.73 
 
 
572 aa  86.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  34.52 
 
 
969 aa  86.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.06 
 
 
969 aa  86.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  25.04 
 
 
1172 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 
1170 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  23.86 
 
 
835 aa  85.5  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  24.16 
 
 
1144 aa  85.5  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  25.94 
 
 
1122 aa  84.7  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
933 aa  84.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  25.74 
 
 
937 aa  84  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.38 
 
 
941 aa  83.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.38 
 
 
941 aa  83.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  25.48 
 
 
1160 aa  83.2  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  26.56 
 
 
1169 aa  82.8  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  35.1 
 
 
1038 aa  82.8  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  31.38 
 
 
1013 aa  82.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  24.59 
 
 
1170 aa  81.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  26.4 
 
 
1169 aa  81.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.39 
 
 
760 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.63 
 
 
964 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  36.6 
 
 
1201 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.18 
 
 
1145 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.33 
 
 
1065 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.33 
 
 
1065 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  24.88 
 
 
955 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
1201 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  33.71 
 
 
971 aa  79.7  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 
962 aa  79.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.22 
 
 
1167 aa  79  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  24.62 
 
 
1167 aa  79  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.25 
 
 
988 aa  78.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  35.51 
 
 
982 aa  78.2  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  33.33 
 
 
1069 aa  78.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1069 aa  78.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  36.16 
 
 
919 aa  78.2  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.61 
 
 
972 aa  78.2  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  35.33 
 
 
774 aa  78.2  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>