More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1535 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  59.45 
 
 
1051 aa  1262    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  60.08 
 
 
1052 aa  1277    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1086 aa  2199    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  59.85 
 
 
1086 aa  1335    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
1080 aa  797    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  34.37 
 
 
1127 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  33.68 
 
 
1099 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  33.57 
 
 
1109 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  32.17 
 
 
1122 aa  415  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  29.44 
 
 
1125 aa  376  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  31.44 
 
 
1117 aa  329  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  28.48 
 
 
1160 aa  325  2e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  28.01 
 
 
1124 aa  270  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.71 
 
 
1016 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.23 
 
 
1143 aa  238  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.04 
 
 
1153 aa  231  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 
1109 aa  230  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 
1131 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
1128 aa  228  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  24.31 
 
 
853 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.82 
 
 
1100 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  26.5 
 
 
1112 aa  213  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 
1140 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.93 
 
 
1086 aa  195  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  26.81 
 
 
1081 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25.98 
 
 
1083 aa  189  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  26.63 
 
 
1065 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  26.29 
 
 
1067 aa  183  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.1 
 
 
1085 aa  183  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  25.21 
 
 
1077 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  27.07 
 
 
1053 aa  172  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  25.45 
 
 
1065 aa  168  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  27.93 
 
 
1082 aa  166  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  25.78 
 
 
1089 aa  165  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
1075 aa  164  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  24.3 
 
 
1072 aa  160  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  24.95 
 
 
1071 aa  156  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  24.42 
 
 
1090 aa  155  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  23.25 
 
 
1077 aa  153  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  25.82 
 
 
1069 aa  152  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  25.14 
 
 
1087 aa  152  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 
1075 aa  151  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  25.34 
 
 
1075 aa  150  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  26.22 
 
 
1077 aa  149  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  25.66 
 
 
1153 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.28 
 
 
1065 aa  147  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  26.14 
 
 
1078 aa  146  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  24.58 
 
 
1064 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  25.24 
 
 
1078 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  26.77 
 
 
1074 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25 
 
 
1167 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.42 
 
 
1170 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  24.83 
 
 
1167 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  24.58 
 
 
1167 aa  121  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.14 
 
 
963 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  22.9 
 
 
1065 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  22.9 
 
 
1065 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.46 
 
 
1172 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  24.69 
 
 
966 aa  108  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.78 
 
 
1160 aa  106  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  22.75 
 
 
560 aa  105  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  24.29 
 
 
942 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  24.18 
 
 
967 aa  105  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  24.05 
 
 
975 aa  105  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 
1013 aa  105  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  24.41 
 
 
1170 aa  105  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  22.58 
 
 
560 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  23.91 
 
 
1160 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  22.58 
 
 
560 aa  103  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  22.85 
 
 
1088 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  22.41 
 
 
560 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  23.33 
 
 
1170 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.22 
 
 
1060 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  23.19 
 
 
932 aa  100  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  23.01 
 
 
1116 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  25.28 
 
 
919 aa  100  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  25.87 
 
 
941 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  24.38 
 
 
949 aa  100  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  31.54 
 
 
1037 aa  99.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  22.71 
 
 
1168 aa  99.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  22.97 
 
 
1170 aa  99.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  22.67 
 
 
947 aa  98.6  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 
1145 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  22.4 
 
 
951 aa  97.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  22.35 
 
 
961 aa  97.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  23.49 
 
 
1138 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  34.5 
 
 
1046 aa  96.3  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  22.99 
 
 
584 aa  95.5  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  20.86 
 
 
922 aa  95.9  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  24.31 
 
 
937 aa  95.1  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  23.33 
 
 
933 aa  95.1  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  23.48 
 
 
584 aa  94.7  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  23.13 
 
 
964 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  22.99 
 
 
1062 aa  94.7  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
1129 aa  94.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  23.04 
 
 
915 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  23.38 
 
 
915 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  23.47 
 
 
960 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  23.38 
 
 
916 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.5 
 
 
969 aa  92.4  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>