More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2252 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  66.36 
 
 		 1075 aa  1466    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  40.4 
 
 		 1064 aa  749    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  40.31 
 
 		 1065 aa  775    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  39.89 
 
 		 1069 aa  771    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  52.34 
 
 		 1082 aa  1108    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  41.39 
 
 		 1112 aa  763    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  59.48 
 
 		 1077 aa  1317    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1075 aa  2214    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  45.5 
 
 		 1083 aa  932    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  45.67 
 
 		 1081 aa  918    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  43.9 
 
 		 1067 aa  881    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  51.65 
 
 		 1074 aa  1083    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  38.59 
 
 		 1053 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  39.22 
 
 		 1071 aa  771    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  54.19 
 
 		 696 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  62.97 
 
 		 1078 aa  1374    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  55.49 
 
 		 1090 aa  1226    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  54.07 
 
 		 1075 aa  1127    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  46.17 
 
 		 1089 aa  920    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1065 aa  650    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.23 
 
 		 1085 aa  915    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  39.09 
 
 		 1077 aa  768    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  40.71 
 
 		 1072 aa  802    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  39.98 
 
 		 1077 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  55.49 
 
 		 1087 aa  1219    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  40.07 
 
 		 1078 aa  791    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 1016 aa  234  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.29 
 
 		 1124 aa  207  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1128 aa  205  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.55 
 
 		 1131 aa  197  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.94 
 
 		 1109 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.06 
 
 		 1153 aa  181  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  27.93 
 
 		 1140 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  25.83 
 
 		 1153 aa  172  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.43 
 
 		 1086 aa  170  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 1080 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  27.53 
 
 		 1052 aa  166  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  24.24 
 
 		 1127 aa  162  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 1086 aa  159  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  28.29 
 
 		 1051 aa  158  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 1100 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.96 
 
 		 1143 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  24.46 
 
 		 853 aa  153  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  26.45 
 
 		 1099 aa  141  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.9 
 
 		 1109 aa  140  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.06 
 
 		 1125 aa  131  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.32 
 
 		 1160 aa  128  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  26.41 
 
 		 1122 aa  127  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  24.64 
 
 		 1086 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  23.97 
 
 		 1117 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.87 
 
 		 961 aa  103  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.8 
 
 		 1172 aa  91.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  25.92 
 
 		 929 aa  90.1  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  29.07 
 
 		 1187 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.47 
 
 		 1065 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.47 
 
 		 1065 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  26.24 
 
 		 960 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  24.58 
 
 		 962 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  37.33 
 
 		 972 aa  84  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  39.32 
 
 		 1060 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  23.24 
 
 		 1062 aa  84  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.06 
 
 		 1170 aa  82.4  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 		 1172 aa  82  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  37.42 
 
 		 966 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  23.35 
 
 		 1170 aa  80.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  30.34 
 
 		 1145 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  35.15 
 
 		 1043 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 1116 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  31.65 
 
 		 964 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  28.03 
 
 		 1065 aa  79.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  23.66 
 
 		 1169 aa  79.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  27.52 
 
 		 945 aa  78.2  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 1170 aa  77.4  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 941 aa  77.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 941 aa  77.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  23.7 
 
 		 889 aa  77.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 		 942 aa  75.5  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.51 
 
 		 877 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.03 
 
 		 1082 aa  74.7  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.06 
 
 		 919 aa  74.7  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  34.19 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  28.7 
 
 		 1046 aa  74.7  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.51 
 
 		 1160 aa  74.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.98 
 
 		 1169 aa  74.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  34.19 
 
 		 969 aa  73.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  31.22 
 
 		 1037 aa  73.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  29.28 
 
 		 946 aa  73.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  30.81 
 
 		 923 aa  73.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 813 aa  73.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  26.64 
 
 		 1167 aa  73.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  32.89 
 
 		 988 aa  72.8  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  31.67 
 
 		 953 aa  72.8  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  32.09 
 
 		 963 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.01 
 
 		 1138 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  31.25 
 
 		 1170 aa  72  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.78 
 
 		 1167 aa  71.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  26.71 
 
 		 932 aa  71.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.3 
 
 		 933 aa  70.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  35.97 
 
 		 947 aa  70.5  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  26.23 
 
 		 1167 aa  70.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>