More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0411 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  55.59 
 
 		 1052 aa  1176    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  53.43 
 
 		 1051 aa  1150    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  59.85 
 
 		 1086 aa  1323    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1086 aa  2234    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  43.34 
 
 		 1080 aa  881    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  33.6 
 
 		 1127 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  31 
 
 		 1099 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  31.87 
 
 		 1122 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  31.69 
 
 		 1109 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  29.21 
 
 		 1125 aa  333  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  29.69 
 
 		 1160 aa  305  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  28.78 
 
 		 1117 aa  303  9e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1016 aa  265  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.92 
 
 		 1124 aa  249  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.66 
 
 		 1109 aa  222  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 1131 aa  220  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.47 
 
 		 1143 aa  204  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.6 
 
 		 1153 aa  200  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1128 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  24.39 
 
 		 1100 aa  189  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  23.74 
 
 		 853 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  24.92 
 
 		 1140 aa  183  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  25.11 
 
 		 1112 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  23.61 
 
 		 1083 aa  177  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  25.33 
 
 		 1065 aa  172  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  25.6 
 
 		 1077 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  23.68 
 
 		 1086 aa  163  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  23.77 
 
 		 1067 aa  161  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  25.35 
 
 		 1075 aa  157  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.04 
 
 		 1085 aa  157  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  26.39 
 
 		 1053 aa  154  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  23.94 
 
 		 1060 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  23.38 
 
 		 1072 aa  145  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1065 aa  140  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  23.32 
 
 		 1081 aa  140  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  22.42 
 
 		 1069 aa  140  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  22.37 
 
 		 1089 aa  139  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  24.41 
 
 		 1082 aa  137  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  24.52 
 
 		 1075 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  22.75 
 
 		 1090 aa  134  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  23.41 
 
 		 1078 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  23.92 
 
 		 1077 aa  131  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  23.41 
 
 		 1071 aa  131  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  23.04 
 
 		 1065 aa  130  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  22.64 
 
 		 1087 aa  129  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  24.76 
 
 		 1074 aa  128  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  24.96 
 
 		 1153 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  22.93 
 
 		 1064 aa  122  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  24.05 
 
 		 1077 aa  121  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  23.58 
 
 		 1078 aa  119  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  25.08 
 
 		 1065 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  25.08 
 
 		 1065 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.33 
 
 		 1170 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  23.61 
 
 		 1075 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  24.54 
 
 		 1167 aa  105  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  24.5 
 
 		 919 aa  105  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  23.99 
 
 		 1167 aa  102  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 1167 aa  102  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  26.08 
 
 		 921 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.79 
 
 		 1170 aa  97.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  23.2 
 
 		 947 aa  97.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.31 
 
 		 1138 aa  96.3  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  25.34 
 
 		 915 aa  94.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  23.73 
 
 		 952 aa  94.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  24.28 
 
 		 1170 aa  94.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  36.14 
 
 		 1194 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  25.59 
 
 		 916 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  25.59 
 
 		 915 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  37.28 
 
 		 1043 aa  92.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  24.03 
 
 		 966 aa  92.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  23.12 
 
 		 1170 aa  90.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  24.63 
 
 		 966 aa  91.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  24.05 
 
 		 1172 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  24.17 
 
 		 929 aa  89.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 963 aa  89.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  24.86 
 
 		 829 aa  89  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  38.28 
 
 		 760 aa  88.6  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  23.62 
 
 		 942 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  22.9 
 
 		 932 aa  87.4  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  24.26 
 
 		 894 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  24.24 
 
 		 949 aa  87.4  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  37.78 
 
 		 957 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  31.73 
 
 		 665 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  32.55 
 
 		 964 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  22.07 
 
 		 922 aa  87  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  24.39 
 
 		 1160 aa  87  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  22.86 
 
 		 967 aa  84.7  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  24.49 
 
 		 1129 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  23.85 
 
 		 933 aa  83.2  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  22.62 
 
 		 1160 aa  83.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.73 
 
 		 1082 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  24.95 
 
 		 962 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  23.21 
 
 		 1172 aa  83.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  23.05 
 
 		 1088 aa  82.4  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  37.93 
 
 		 969 aa  82  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  22.62 
 
 		 1169 aa  82  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  24.09 
 
 		 1046 aa  81.6  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  25.55 
 
 		 1137 aa  81.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  34.18 
 
 		 986 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  24.49 
 
 		 1145 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>