More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0240 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  41.57 
 
 		 1074 aa  807    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  41.15 
 
 		 1075 aa  827    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  78.42 
 
 		 1065 aa  1700    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  42.52 
 
 		 1075 aa  857    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  72.97 
 
 		 1077 aa  1587    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  39.96 
 
 		 1112 aa  755    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  50 
 
 		 1083 aa  1101    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  54.48 
 
 		 1067 aa  1181    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  40.46 
 
 		 1077 aa  747    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  74.74 
 
 		 1064 aa  1620    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  40.78 
 
 		 1082 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  68.76 
 
 		 1071 aa  1483    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  43.81 
 
 		 1090 aa  871    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  73.85 
 
 		 1069 aa  1630    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.61 
 
 		 1085 aa  1005    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  66.17 
 
 		 1077 aa  1475    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1072 aa  2206    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  37.56 
 
 		 1053 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  48.29 
 
 		 1081 aa  1012    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  40.16 
 
 		 1087 aa  810    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  40.71 
 
 		 1075 aa  801    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  72.47 
 
 		 1078 aa  1610    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  40.67 
 
 		 1078 aa  756    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  39.98 
 
 		 1065 aa  657    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  50.37 
 
 		 1089 aa  1037    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  40.26 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1016 aa  232  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  28.28 
 
 		 1131 aa  226  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  25.38 
 
 		 1124 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  26.65 
 
 		 1143 aa  211  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 1128 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.84 
 
 		 1153 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.51 
 
 		 1100 aa  174  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  27.25 
 
 		 853 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  27.41 
 
 		 1086 aa  166  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  24.71 
 
 		 1051 aa  165  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  24.3 
 
 		 1086 aa  160  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  24.68 
 
 		 1052 aa  158  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  25.54 
 
 		 1109 aa  151  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 1140 aa  148  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.44 
 
 		 1080 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.38 
 
 		 1086 aa  145  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  26.12 
 
 		 1060 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  23.66 
 
 		 1099 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  22.35 
 
 		 1127 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.47 
 
 		 1125 aa  128  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  23.96 
 
 		 1109 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  36.16 
 
 		 1153 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 		 967 aa  97.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  25.55 
 
 		 915 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  25.68 
 
 		 915 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  25.55 
 
 		 916 aa  88.6  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.74 
 
 		 952 aa  87.4  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  36.75 
 
 		 972 aa  87  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  23.7 
 
 		 915 aa  86.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  29.05 
 
 		 1117 aa  86.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.35 
 
 		 966 aa  84.7  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  24.4 
 
 		 969 aa  79.7  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  27.62 
 
 		 1065 aa  80.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.29 
 
 		 1147 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  38.46 
 
 		 1043 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  23.38 
 
 		 962 aa  79.7  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  27.47 
 
 		 1187 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.64 
 
 		 933 aa  79  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  25.94 
 
 		 1165 aa  78.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  31.16 
 
 		 1122 aa  78.6  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  34.66 
 
 		 946 aa  78.2  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  21.86 
 
 		 1160 aa  77.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  37.82 
 
 		 950 aa  77.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 964 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  22.3 
 
 		 1062 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 923 aa  73.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  30.93 
 
 		 910 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  32.3 
 
 		 1170 aa  72.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  34.72 
 
 		 1037 aa  72  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 940 aa  72.4  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  31.97 
 
 		 1065 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  31.97 
 
 		 1065 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  32.48 
 
 		 945 aa  71.6  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 813 aa  71.6  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 		 968 aa  71.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.17 
 
 		 835 aa  71.6  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.85 
 
 		 949 aa  71.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 941 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 941 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  28.33 
 
 		 541 aa  71.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  32.05 
 
 		 1013 aa  70.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1144 aa  71.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  33.08 
 
 		 948 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.11 
 
 		 1046 aa  70.5  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31.61 
 
 		 1169 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.63 
 
 		 919 aa  70.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  30.67 
 
 		 889 aa  69.7  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  31.68 
 
 		 1172 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  31.13 
 
 		 1169 aa  69.3  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  34.57 
 
 		 1057 aa  69.7  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  35.86 
 
 		 1160 aa  69.7  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 1170 aa  69.7  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  29.94 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>