More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2172 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  45.03 
 
 		 915 aa  763    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  44.3 
 
 		 910 aa  730    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  100 
 
 		 922 aa  1873    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  50.05 
 
 		 924 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  50.92 
 
 		 928 aa  879    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  35.91 
 
 		 889 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  26.34 
 
 		 1065 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  26.34 
 
 		 1065 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  30.1 
 
 		 1187 aa  118  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  25.16 
 
 		 1037 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.53 
 
 		 1147 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  25.52 
 
 		 1167 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.95 
 
 		 969 aa  100  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  30.07 
 
 		 572 aa  100  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  22.94 
 
 		 1016 aa  98.6  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  36.48 
 
 		 1046 aa  97.8  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.01 
 
 		 1170 aa  97.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  24.27 
 
 		 1177 aa  96.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  29.69 
 
 		 929 aa  96.3  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  20.86 
 
 		 1086 aa  95.1  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  32.56 
 
 		 1095 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  21.12 
 
 		 1052 aa  93.2  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  29.01 
 
 		 932 aa  92.8  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.93 
 
 		 933 aa  92.8  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  28.38 
 
 		 960 aa  91.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.05 
 
 		 829 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  27.07 
 
 		 919 aa  91.3  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 942 aa  91.3  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.83 
 
 		 969 aa  90.9  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  30.59 
 
 		 1167 aa  90.1  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.97 
 
 		 584 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.21 
 
 		 962 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.85 
 
 		 971 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  36.3 
 
 		 1043 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 941 aa  89  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 1167 aa  89  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.86 
 
 		 1169 aa  89  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 941 aa  89  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  29.08 
 
 		 949 aa  88.6  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  36.94 
 
 		 1169 aa  88.2  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  30.93 
 
 		 951 aa  87.8  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  36.88 
 
 		 1136 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.3 
 
 		 988 aa  87.4  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  39.6 
 
 		 1168 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  19.61 
 
 		 1051 aa  87  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.62 
 
 		 1049 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  31.88 
 
 		 1201 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.72 
 
 		 966 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  22.07 
 
 		 1086 aa  87  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  31.88 
 
 		 1201 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 		 947 aa  85.9  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  53.66 
 
 		 1129 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  32.99 
 
 		 1165 aa  85.1  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.16 
 
 		 963 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.57 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  41.11 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  37.66 
 
 		 1160 aa  84.3  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  34.93 
 
 		 925 aa  84  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.34 
 
 		 1212 aa  84  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  33.33 
 
 		 760 aa  84  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  30.39 
 
 		 921 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  37.5 
 
 		 922 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 1145 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  32.31 
 
 		 1069 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 1170 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  28.65 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  32.31 
 
 		 1069 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  32.43 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  31.36 
 
 		 915 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  31.36 
 
 		 916 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  34.25 
 
 		 927 aa  82.8  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 877 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1046 aa  82.8  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  35.76 
 
 		 1137 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  31.36 
 
 		 915 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  26.42 
 
 		 964 aa  82  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 1172 aa  82  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.84 
 
 		 1028 aa  81.6  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  32.02 
 
 		 906 aa  81.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  50 
 
 		 1116 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.25 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  36.89 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  35.22 
 
 		 1170 aa  81.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.94 
 
 		 835 aa  80.9  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  38.02 
 
 		 560 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  35.94 
 
 		 1044 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  36.11 
 
 		 1194 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  31.79 
 
 		 949 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1144 aa  80.9  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  34.64 
 
 		 1131 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  36.07 
 
 		 560 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  36.07 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  25.18 
 
 		 555 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  36.07 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  36.07 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  34.27 
 
 		 774 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  36.07 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.46 
 
 		 972 aa  80.1  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  29.32 
 
 		 967 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.69 
 
 		 952 aa  80.1  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>