More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3437 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  100 
 
 		 1124 aa  2295    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  40.8 
 
 		 1143 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  36.07 
 
 		 1153 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  29.76 
 
 		 1016 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.97 
 
 		 1131 aa  318  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.94 
 
 		 1085 aa  289  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  27.31 
 
 		 1052 aa  282  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  27 
 
 		 1051 aa  280  8e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  28.01 
 
 		 1086 aa  276  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1077 aa  259  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25.77 
 
 		 1083 aa  257  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 1077 aa  256  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 1086 aa  254  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  26.79 
 
 		 1071 aa  244  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.42 
 
 		 1080 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.13 
 
 		 1067 aa  242  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  25.1 
 
 		 1112 aa  242  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  26.67 
 
 		 1127 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  24.68 
 
 		 1081 aa  239  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 1128 aa  239  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  27.65 
 
 		 1064 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  26.7 
 
 		 1069 aa  237  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.74 
 
 		 1099 aa  236  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.18 
 
 		 1109 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  28.32 
 
 		 1053 aa  230  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  25.48 
 
 		 1072 aa  230  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.45 
 
 		 1065 aa  228  4e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.52 
 
 		 1100 aa  227  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  24.69 
 
 		 1082 aa  226  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 		 1078 aa  225  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  27.18 
 
 		 853 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  25.29 
 
 		 1089 aa  221  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 1075 aa  218  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1065 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  27.53 
 
 		 1077 aa  214  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.7 
 
 		 1065 aa  213  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  25.99 
 
 		 1075 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  26.57 
 
 		 1140 aa  204  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.14 
 
 		 1086 aa  204  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  25.35 
 
 		 1090 aa  203  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  27.27 
 
 		 1074 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 1075 aa  201  9e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  24.44 
 
 		 1087 aa  193  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  26.25 
 
 		 1078 aa  182  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  23.94 
 
 		 1109 aa  180  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  25.86 
 
 		 1122 aa  175  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.03 
 
 		 1117 aa  170  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  26.59 
 
 		 1153 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  26.28 
 
 		 1125 aa  167  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.17 
 
 		 1160 aa  156  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  26.83 
 
 		 1060 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 963 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.98 
 
 		 947 aa  117  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  27.29 
 
 		 929 aa  112  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.61 
 
 		 932 aa  110  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  26.98 
 
 		 960 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  25.99 
 
 		 949 aa  108  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  25.59 
 
 		 951 aa  107  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  23.58 
 
 		 696 aa  105  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.56 
 
 		 952 aa  93.2  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  24.52 
 
 		 919 aa  92.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  24.88 
 
 		 949 aa  89.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  26.26 
 
 		 1088 aa  88.2  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  23.97 
 
 		 1165 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  24.09 
 
 		 1062 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  24 
 
 		 1172 aa  85.5  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  23.59 
 
 		 1057 aa  84.7  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  23.44 
 
 		 1049 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.96 
 
 		 966 aa  83.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  24.1 
 
 		 950 aa  82.8  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  35.48 
 
 		 1065 aa  82.4  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  35.48 
 
 		 1065 aa  82.4  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  24.39 
 
 		 1147 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.74 
 
 		 969 aa  81.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 933 aa  81.3  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.91 
 
 		 1028 aa  79.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  24.65 
 
 		 1170 aa  79.7  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.14 
 
 		 964 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 964 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  34.56 
 
 		 1046 aa  79  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.66 
 
 		 1201 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  24.35 
 
 		 1170 aa  78.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 1201 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.33 
 
 		 941 aa  77.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  23.01 
 
 		 829 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.33 
 
 		 941 aa  77.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 		 921 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  38.68 
 
 		 1043 aa  77  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  22.64 
 
 		 1138 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  30.41 
 
 		 1037 aa  76.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  23.5 
 
 		 1170 aa  76.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.02 
 
 		 915 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  23.43 
 
 		 1169 aa  76.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.02 
 
 		 916 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1013 aa  75.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  31.41 
 
 		 975 aa  75.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  22.77 
 
 		 1170 aa  75.5  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.48 
 
 		 962 aa  75.5  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  23.76 
 
 		 1172 aa  74.7  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  25.53 
 
 		 1187 aa  74.7  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>