More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0580 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  41.11 
 
 		 1075 aa  809    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  66.82 
 
 		 1069 aa  1432    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  40.09 
 
 		 1078 aa  744    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  67.47 
 
 		 1077 aa  1456    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  40.36 
 
 		 1112 aa  774    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  42.33 
 
 		 1082 aa  792    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  55.97 
 
 		 1067 aa  1193    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  40.74 
 
 		 1074 aa  796    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  39.1 
 
 		 1053 aa  705    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  66.29 
 
 		 1064 aa  1437    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  48.24 
 
 		 1081 aa  1018    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  41.45 
 
 		 1075 aa  846    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  100 
 
 		 1071 aa  2192    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  49.17 
 
 		 1089 aa  1017    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  42.57 
 
 		 1090 aa  843    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  39.28 
 
 		 1075 aa  784    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.84 
 
 		 1085 aa  1006    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  65.03 
 
 		 1077 aa  1432    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  37.79 
 
 		 1065 aa  705    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  68.76 
 
 		 1072 aa  1502    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  41.22 
 
 		 1077 aa  764    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  67.47 
 
 		 1065 aa  1460    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  39.93 
 
 		 1087 aa  811    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  65.92 
 
 		 1078 aa  1424    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  50.41 
 
 		 1083 aa  1113    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  38.66 
 
 		 696 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  29.3 
 
 		 1016 aa  250  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  29.84 
 
 		 1131 aa  240  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.96 
 
 		 1124 aa  239  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 		 1143 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.84 
 
 		 1153 aa  207  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.37 
 
 		 1128 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  27.81 
 
 		 1086 aa  186  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.47 
 
 		 853 aa  180  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.3 
 
 		 1100 aa  178  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  27.94 
 
 		 1153 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  25.47 
 
 		 1051 aa  167  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.01 
 
 		 1109 aa  164  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  24.94 
 
 		 1086 aa  163  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  24.55 
 
 		 1052 aa  159  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  22.81 
 
 		 1127 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 1080 aa  147  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  26.85 
 
 		 1060 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 		 1086 aa  142  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  22.97 
 
 		 1099 aa  136  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  25.12 
 
 		 1160 aa  130  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  23.17 
 
 		 1117 aa  130  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 1122 aa  122  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.04 
 
 		 1125 aa  119  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.96 
 
 		 1109 aa  112  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  40.4 
 
 		 1140 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  24.79 
 
 		 964 aa  96.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  24.75 
 
 		 942 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  23.39 
 
 		 915 aa  85.5  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  24.44 
 
 		 969 aa  84.7  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  28.25 
 
 		 1187 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  35.07 
 
 		 1065 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  35.07 
 
 		 1065 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.91 
 
 		 1147 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  24.84 
 
 		 949 aa  83.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  23.33 
 
 		 1062 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.38 
 
 		 966 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  39.57 
 
 		 1037 aa  80.5  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  33.77 
 
 		 1043 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 1170 aa  80.9  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  35.98 
 
 		 972 aa  80.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  36.94 
 
 		 964 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  33.7 
 
 		 933 aa  79  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  25.86 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  23.08 
 
 		 988 aa  78.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  22.75 
 
 		 952 aa  78.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 941 aa  77.8  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 941 aa  77.8  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  33.81 
 
 		 946 aa  77.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  31.46 
 
 		 940 aa  77.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  29.37 
 
 		 1013 aa  77.4  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.52 
 
 		 1172 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  35.71 
 
 		 1172 aa  76.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  30.93 
 
 		 910 aa  76.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1144 aa  76.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.87 
 
 		 835 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  32 
 
 		 950 aa  75.5  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.64 
 
 		 933 aa  75.5  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  30.81 
 
 		 1116 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.99 
 
 		 1212 aa  75.1  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.74 
 
 		 949 aa  74.3  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 1169 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  34.07 
 
 		 945 aa  74.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  37.5 
 
 		 1169 aa  73.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  33.93 
 
 		 1138 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  35.06 
 
 		 1170 aa  73.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 		 1145 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  33.33 
 
 		 760 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  33.89 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  34.88 
 
 		 962 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 819 aa  72.4  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  34.56 
 
 		 906 aa  72  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  23.49 
 
 		 937 aa  72  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  33.83 
 
 		 1170 aa  72  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  33.59 
 
 		 1129 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>