More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0278 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  46.2 
 
 		 910 aa  788    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  45.03 
 
 		 922 aa  771    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  100 
 
 		 915 aa  1889    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  50 
 
 		 924 aa  872    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  50.97 
 
 		 928 aa  871    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  36.79 
 
 		 889 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.47 
 
 		 1065 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.47 
 
 		 1065 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.04 
 
 		 1172 aa  111  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  31.1 
 
 		 1187 aa  111  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  23.93 
 
 		 1043 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  35.14 
 
 		 1170 aa  95.1  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  22.88 
 
 		 1167 aa  94.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  36.11 
 
 		 1194 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  32.29 
 
 		 1169 aa  94.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.73 
 
 		 760 aa  94.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  36.08 
 
 		 1170 aa  94  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.25 
 
 		 1172 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32.87 
 
 		 1170 aa  92.8  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  35.86 
 
 		 1160 aa  92  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  34.03 
 
 		 829 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  35.9 
 
 		 1169 aa  91.3  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.76 
 
 		 969 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.82 
 
 		 1212 aa  90.1  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 906 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 1137 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 1136 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  22.89 
 
 		 1167 aa  89  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  23.85 
 
 		 1072 aa  88.6  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  21.65 
 
 		 1143 aa  88.2  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  23.11 
 
 		 1075 aa  88.2  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1131 aa  88.2  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  23.57 
 
 		 1082 aa  87.8  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  22.78 
 
 		 1067 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  29.73 
 
 		 1167 aa  87.4  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  32.12 
 
 		 988 aa  87.4  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  33.33 
 
 		 774 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  19.33 
 
 		 1052 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  34.18 
 
 		 1168 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.04 
 
 		 572 aa  85.9  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.08 
 
 		 1147 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.9 
 
 		 1170 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.46 
 
 		 919 aa  85.5  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  36.65 
 
 		 724 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  21.22 
 
 		 1089 aa  84.7  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  23.27 
 
 		 1071 aa  84.7  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.37 
 
 		 1028 aa  84  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  36.88 
 
 		 1037 aa  83.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  21.63 
 
 		 1081 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  34.97 
 
 		 964 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  22.6 
 
 		 1078 aa  81.3  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  31.08 
 
 		 1112 aa  81.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.38 
 
 		 971 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  25.77 
 
 		 952 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  35.04 
 
 		 949 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.92 
 
 		 1109 aa  79  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  32.14 
 
 		 1046 aa  79  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  25.64 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  34.35 
 
 		 1069 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  33.57 
 
 		 1058 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  34.35 
 
 		 1069 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  22.6 
 
 		 1065 aa  78.2  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  49.35 
 
 		 1129 aa  77.8  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.05 
 
 		 1095 aa  77.8  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.03 
 
 		 1145 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  27.82 
 
 		 969 aa  77  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1144 aa  77  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.59 
 
 		 835 aa  77  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 877 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  26.48 
 
 		 949 aa  76.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.95 
 
 		 1201 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  32.35 
 
 		 922 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 1201 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  29.09 
 
 		 1122 aa  76.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  43.43 
 
 		 1116 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  22.9 
 
 		 1053 aa  76.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  35.04 
 
 		 975 aa  75.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  23.31 
 
 		 1080 aa  76.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  33.86 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  32.45 
 
 		 1165 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  27.88 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1031 aa  75.5  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.47 
 
 		 894 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.51 
 
 		 925 aa  75.1  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.08 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.39 
 
 		 1046 aa  74.7  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.27 
 
 		 1013 aa  74.7  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  35.42 
 
 		 986 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  38.78 
 
 		 961 aa  74.7  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  38.46 
 
 		 951 aa  74.7  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  30.82 
 
 		 927 aa  74.3  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.3 
 
 		 1045 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  33.07 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>