More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0716 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 819 aa  1654    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  46.11 
 
 		 813 aa  672    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 		 1013 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.57 
 
 		 801 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.01 
 
 		 877 aa  149  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.84 
 
 		 805 aa  148  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.91 
 
 		 952 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.13 
 
 		 919 aa  141  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.61 
 
 		 560 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 		 560 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  28.23 
 
 		 555 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  29.27 
 
 		 941 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  28.05 
 
 		 554 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  26.45 
 
 		 560 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  25.99 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  26.45 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  26.45 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  26.45 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  26.45 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  26.45 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  26.27 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  26.45 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 1172 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  27.94 
 
 		 923 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  26.78 
 
 		 1168 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  24.6 
 
 		 949 aa  121  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.63 
 
 		 971 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.26 
 
 		 1167 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  25.77 
 
 		 1069 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 		 1069 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.95 
 
 		 1170 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  26.91 
 
 		 1167 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  27.71 
 
 		 919 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.99 
 
 		 829 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  26.87 
 
 		 572 aa  115  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.28 
 
 		 467 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.07 
 
 		 933 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.81 
 
 		 1170 aa  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  27.93 
 
 		 932 aa  114  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  26.43 
 
 		 1167 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.29 
 
 		 969 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.82 
 
 		 953 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  26.96 
 
 		 1058 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  25.9 
 
 		 964 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  23.08 
 
 		 1062 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  24.47 
 
 		 1170 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  26.1 
 
 		 952 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.7 
 
 		 1045 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.3 
 
 		 952 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  25.64 
 
 		 937 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.3 
 
 		 952 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.85 
 
 		 941 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.85 
 
 		 941 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.31 
 
 		 584 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.03 
 
 		 584 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  25.86 
 
 		 1031 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  25.87 
 
 		 952 aa  105  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  24.95 
 
 		 1046 aa  103  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  24.51 
 
 		 954 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.73 
 
 		 1057 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  26.88 
 
 		 969 aa  103  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  24.31 
 
 		 982 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  26.11 
 
 		 973 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.89 
 
 		 1028 aa  101  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25 
 
 		 988 aa  100  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  25.38 
 
 		 945 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  25.4 
 
 		 1095 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  24.82 
 
 		 1138 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  26.25 
 
 		 1038 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  26.8 
 
 		 961 aa  99  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  25.3 
 
 		 894 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  31.97 
 
 		 1194 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  27.17 
 
 		 946 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  27.29 
 
 		 1044 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  26.27 
 
 		 958 aa  96.3  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  26.58 
 
 		 956 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  26.27 
 
 		 669 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  25.49 
 
 		 957 aa  95.5  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  28.4 
 
 		 916 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  28.4 
 
 		 915 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  28.2 
 
 		 915 aa  94.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  27.15 
 
 		 1046 aa  94.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.24 
 
 		 951 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  26.32 
 
 		 541 aa  94.7  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  26.52 
 
 		 1165 aa  94.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33.96 
 
 		 1147 aa  94  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  25.41 
 
 		 1201 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  25.41 
 
 		 1201 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  31.51 
 
 		 1137 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  26.74 
 
 		 921 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  31.22 
 
 		 1160 aa  91.3  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.13 
 
 		 1212 aa  90.9  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  27.1 
 
 		 1049 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  32.05 
 
 		 1136 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  24.65 
 
 		 958 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1131 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 		 1129 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  33.51 
 
 		 1169 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  32.48 
 
 		 968 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  32.48 
 
 		 968 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>