More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2490 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  55.77 
 
 		 1075 aa  1202    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  37.6 
 
 		 1065 aa  682    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  38.88 
 
 		 1069 aa  766    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  44.46 
 
 		 1089 aa  927    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  49.31 
 
 		 1074 aa  1053    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  38.92 
 
 		 1077 aa  778    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  51.51 
 
 		 1077 aa  1106    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  55.49 
 
 		 1075 aa  1218    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  43.57 
 
 		 1067 aa  891    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  39.23 
 
 		 1064 aa  767    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  45.31 
 
 		 1081 aa  940    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  38.27 
 
 		 1053 aa  680    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  40.67 
 
 		 1112 aa  795    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  54.1 
 
 		 1078 aa  1163    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  39.93 
 
 		 1071 aa  807    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  54.08 
 
 		 1082 aa  1203    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  66.48 
 
 		 1090 aa  1537    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.8 
 
 		 1085 aa  916    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  44.9 
 
 		 1083 aa  941    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  39.98 
 
 		 1077 aa  811    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  40.27 
 
 		 1072 aa  814    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  65.37 
 
 		 696 aa  951    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  100 
 
 		 1087 aa  2245    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  39.37 
 
 		 1065 aa  781    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  50.78 
 
 		 1075 aa  1087    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  39.78 
 
 		 1078 aa  779    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  26.7 
 
 		 1016 aa  220  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  24.34 
 
 		 1124 aa  191  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  28.94 
 
 		 1109 aa  188  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.36 
 
 		 1131 aa  187  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  25.43 
 
 		 1153 aa  182  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  23.04 
 
 		 1143 aa  179  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.11 
 
 		 1052 aa  179  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.61 
 
 		 1051 aa  174  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1140 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  25.54 
 
 		 1086 aa  158  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.56 
 
 		 1100 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  25.56 
 
 		 853 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.25 
 
 		 1080 aa  152  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.9 
 
 		 1160 aa  143  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25 
 
 		 1086 aa  141  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.45 
 
 		 1109 aa  137  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.03 
 
 		 1127 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  22.79 
 
 		 1086 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.35 
 
 		 1117 aa  128  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.49 
 
 		 1065 aa  128  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  23.63 
 
 		 1060 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 1128 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  25.51 
 
 		 1122 aa  122  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  23.97 
 
 		 1099 aa  120  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  23.38 
 
 		 1125 aa  104  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  31.16 
 
 		 1153 aa  99  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.12 
 
 		 963 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  22.79 
 
 		 919 aa  93.2  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  21.67 
 
 		 1170 aa  88.2  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.81 
 
 		 584 aa  84  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 942 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  27.35 
 
 		 945 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.41 
 
 		 1160 aa  79.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.65 
 
 		 584 aa  79.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.35 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.35 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  25.4 
 
 		 941 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 		 940 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.67 
 
 		 1172 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  31.69 
 
 		 1043 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  29.75 
 
 		 950 aa  75.5  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  31.03 
 
 		 1037 aa  75.1  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.95 
 
 		 929 aa  73.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  22.59 
 
 		 1082 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  22.99 
 
 		 969 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1144 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.22 
 
 		 835 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.86 
 
 		 1169 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 1116 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  26.13 
 
 		 964 aa  73.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  36.15 
 
 		 933 aa  73.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  31.36 
 
 		 946 aa  73.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.88 
 
 		 952 aa  72.8  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  33.73 
 
 		 966 aa  72.4  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.64 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.51 
 
 		 1187 aa  72  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 		 941 aa  71.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  34.62 
 
 		 969 aa  71.6  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  29.67 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 		 941 aa  71.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.82 
 
 		 1169 aa  71.2  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.17 
 
 		 966 aa  71.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.22 
 
 		 949 aa  70.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.63 
 
 		 933 aa  70.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 		 1177 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.59 
 
 		 1138 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.33 
 
 		 972 aa  70.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  22.65 
 
 		 958 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.18 
 
 		 932 aa  69.3  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  29.83 
 
 		 669 aa  69.3  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  29.54 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  29.54 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  29.54 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 813 aa  68.9  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>