More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1126 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  40.29 
 
 		 1075 aa  783    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  39.32 
 
 		 1077 aa  717    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  41.5 
 
 		 1074 aa  777    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  45.8 
 
 		 1081 aa  960    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  52.05 
 
 		 1067 aa  1135    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  73.07 
 
 		 1069 aa  1596    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  38.57 
 
 		 1112 aa  729    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  66.29 
 
 		 1071 aa  1456    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  74 
 
 		 1077 aa  1607    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  41.42 
 
 		 1090 aa  821    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  49.03 
 
 		 1083 aa  1087    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.35 
 
 		 1085 aa  976    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  78.27 
 
 		 1065 aa  1724    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  63.68 
 
 		 1077 aa  1429    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  74.74 
 
 		 1072 aa  1663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  41.72 
 
 		 1082 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  40.49 
 
 		 1075 aa  775    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  39.57 
 
 		 1053 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  100 
 
 		 1064 aa  2178    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  39.41 
 
 		 1087 aa  781    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  72.18 
 
 		 1078 aa  1603    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  39.78 
 
 		 1078 aa  716    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1065 aa  650    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  49.31 
 
 		 1089 aa  1016    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  41.08 
 
 		 1075 aa  815    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  39.26 
 
 		 696 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 1131 aa  244  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.7 
 
 		 1124 aa  237  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1016 aa  226  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  26.3 
 
 		 1143 aa  214  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  26.58 
 
 		 1153 aa  199  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 1128 aa  193  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  24.61 
 
 		 1052 aa  160  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.98 
 
 		 1100 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 853 aa  160  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  24.52 
 
 		 1051 aa  159  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  24.53 
 
 		 1109 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.8 
 
 		 1080 aa  155  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.35 
 
 		 1086 aa  152  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 1140 aa  149  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.63 
 
 		 1099 aa  147  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  24.54 
 
 		 1086 aa  147  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  25.88 
 
 		 1060 aa  138  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.33 
 
 		 1160 aa  130  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.2 
 
 		 1086 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.12 
 
 		 1127 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  23.2 
 
 		 1065 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  28.83 
 
 		 1153 aa  102  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  27.07 
 
 		 1109 aa  100  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  26.11 
 
 		 933 aa  88.2  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.03 
 
 		 966 aa  87.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  33.67 
 
 		 1122 aa  87.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  31.97 
 
 		 1117 aa  84.7  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  27.95 
 
 		 1147 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  26.28 
 
 		 1125 aa  82.8  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  24.73 
 
 		 969 aa  82.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  35.63 
 
 		 950 aa  82  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  35.37 
 
 		 1065 aa  81.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  35.37 
 
 		 1065 aa  81.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  39.23 
 
 		 1043 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  23.97 
 
 		 962 aa  79.7  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  25.26 
 
 		 952 aa  79  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  34.42 
 
 		 972 aa  77.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  22.51 
 
 		 915 aa  77.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.07 
 
 		 1170 aa  77.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 		 968 aa  76.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  31.87 
 
 		 964 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  37.1 
 
 		 1168 aa  76.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.17 
 
 		 835 aa  75.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  37.41 
 
 		 840 aa  75.5  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  30.56 
 
 		 941 aa  75.5  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  32.04 
 
 		 1160 aa  75.5  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1144 aa  75.5  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  37.01 
 
 		 1169 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  37.01 
 
 		 1169 aa  75.1  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  30.39 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  23.97 
 
 		 1187 aa  74.7  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  33.53 
 
 		 1170 aa  74.3  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  32.39 
 
 		 946 aa  73.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.19 
 
 		 919 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  35.76 
 
 		 1013 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  34.4 
 
 		 1172 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  27.44 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  35.42 
 
 		 1037 aa  72.4  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32.54 
 
 		 1170 aa  72.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  29.44 
 
 		 948 aa  72.4  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  31.82 
 
 		 584 aa  72  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 1177 aa  72  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  33.6 
 
 		 1136 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.72 
 
 		 1057 aa  71.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  31.46 
 
 		 945 aa  71.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  33.6 
 
 		 1194 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 1137 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  30.94 
 
 		 964 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  31.21 
 
 		 829 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  33.13 
 
 		 1038 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.21 
 
 		 1138 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  33.54 
 
 		 1046 aa  70.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.97 
 
 		 961 aa  69.7  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  34.4 
 
 		 1131 aa  69.7  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>