153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3181 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  42.92 
 
 		 1062 aa  791    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  100 
 
 		 1088 aa  2185    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  22.71 
 
 		 1052 aa  107  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  22.85 
 
 		 1086 aa  107  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  23.64 
 
 		 1051 aa  102  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  29 
 
 		 1016 aa  100  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 1143 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.05 
 
 		 1124 aa  89.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0991  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1155 aa  84.7  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.2 
 
 		 1086 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  22.57 
 
 		 1065 aa  75.1  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.15 
 
 		 1085 aa  72.8  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  22.18 
 
 		 1127 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1080 aa  68.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  26.84 
 
 		 1122 aa  67.4  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.48 
 
 		 1153 aa  67.4  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  24.22 
 
 		 1128 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  26.67 
 
 		 1153 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  31.37 
 
 		 1060 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  20.57 
 
 		 1099 aa  62.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.25 
 
 		 1160 aa  62  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  24.09 
 
 		 1131 aa  62.4  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  27.19 
 
 		 1125 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  21.41 
 
 		 1053 aa  59.3  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  25.58 
 
 		 1071 aa  58.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  25 
 
 		 1083 aa  58.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  27.5 
 
 		 541 aa  56.2  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  25.63 
 
 		 1065 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  25.63 
 
 		 1065 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  23.76 
 
 		 1109 aa  56.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25 
 
 		 1067 aa  55.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 968 aa  55.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  22.22 
 
 		 1117 aa  55.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  21.63 
 
 		 1109 aa  55.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  25.58 
 
 		 1077 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  25.43 
 
 		 1072 aa  54.3  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  25.58 
 
 		 1089 aa  54.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 963 aa  53.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  34.15 
 
 		 923 aa  53.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4392  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1069 aa  53.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  24.52 
 
 		 951 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  25 
 
 		 1081 aa  53.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.48 
 
 		 933 aa  52.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  23.72 
 
 		 966 aa  52.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 		 918 aa  52  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  24.86 
 
 		 1069 aa  51.6  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1046 aa  51.6  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 1112 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  24.42 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  24.26 
 
 		 918 aa  51.6  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  35.94 
 
 		 1075 aa  50.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.39 
 
 		 964 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  24.26 
 
 		 918 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1065 aa  51.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  23.93 
 
 		 918 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 		 1002 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.03 
 
 		 918 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  23.71 
 
 		 918 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  23.93 
 
 		 918 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.03 
 
 		 918 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  27.67 
 
 		 906 aa  50.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  23.82 
 
 		 1049 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.88 
 
 		 559 aa  50.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  20.99 
 
 		 1075 aa  50.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  23.71 
 
 		 918 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  23.93 
 
 		 918 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  30.77 
 
 		 952 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.89 
 
 		 919 aa  49.3  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.46 
 
 		 449 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  30.14 
 
 		 973 aa  49.3  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  24.43 
 
 		 1065 aa  49.3  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 952 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  30.77 
 
 		 952 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  30.77 
 
 		 952 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  27.82 
 
 		 1187 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  31.73 
 
 		 958 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.46 
 
 		 449 aa  48.9  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.35 
 
 		 1110 aa  48.9  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  23.84 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.18 
 
 		 961 aa  48.5  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1172 aa  48.5  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  30.5 
 
 		 1086 aa  48.5  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  33.87 
 
 		 969 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  30.06 
 
 		 813 aa  48.5  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.52 
 
 		 953 aa  48.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.06 
 
 		 449 aa  48.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 1140 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  25 
 
 		 1181 aa  47.8  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  24.34 
 
 		 1175 aa  48.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.68 
 
 		 449 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.72 
 
 		 949 aa  47.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  22.1 
 
 		 1007 aa  48.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  24.28 
 
 		 1078 aa  47.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  23.77 
 
 		 1901 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  26.29 
 
 		 1557 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.68 
 
 		 1068 aa  48.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  29.37 
 
 		 669 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  26 
 
 		 447 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  26.4 
 
 		 943 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 958 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>