More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0944 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 502 aa  1025    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  36.69 
 
 		 750 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  37.55 
 
 		 769 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  36.13 
 
 		 763 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  36.94 
 
 		 749 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  35.48 
 
 		 754 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.92 
 
 		 756 aa  300  4e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  35.96 
 
 		 938 aa  299  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  35.09 
 
 		 745 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  34.51 
 
 		 749 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  34.19 
 
 		 749 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  32.7 
 
 		 836 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  34.69 
 
 		 751 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  32.32 
 
 		 820 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  33.07 
 
 		 751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  31.38 
 
 		 829 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  34.52 
 
 		 776 aa  266  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  35.4 
 
 		 808 aa  264  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  32.7 
 
 		 851 aa  250  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  31.57 
 
 		 833 aa  249  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  30.36 
 
 		 971 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  29.08 
 
 		 1565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  29.11 
 
 		 941 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  29.33 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.25 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  26.19 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1354  type III restriction enzyme, res subunit  28.86 
 
 		 660 aa  86.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0575606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  37.4 
 
 		 1528 aa  80.1  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.13 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.57 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0399  ATP-dependent RNA helicase RhlB  33.09 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 		 550 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3928  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0449  ATP-dependent RNA helicase RhlB  35.34 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3876  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.587664  hitchhiker  0.000145647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0461  ATP-dependent RNA helicase RhlB  37.5 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.388345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0514  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0317755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3057  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.71 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3951  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4109  ATP-dependent RNA helicase RhlB  37.25 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297113  hitchhiker  0.000114369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4069  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.341266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3432  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0407  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2006  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.75 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0411  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3614  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0410  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.54 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.19 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  31.67 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  32.72 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5577  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  29.88 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0339  ATP-dependent RNA helicase RhlB  35.58 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.181774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.47 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.47 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.47 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.36 
 
 		 744 aa  63.9  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5639  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  29.88 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0860387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5592  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.88 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.99386  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24549  predicted protein  38.46 
 
 		 346 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.15 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 607 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5370  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  29.7 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200249  hitchhiker  0.000118205 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0773  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.97 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.463701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.23 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 		 595 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  31.94 
 
 		 531 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  33.33 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.48 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.09 
 
 		 916 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2480  DEAD/DEAH box helicase-like  32.17 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.045241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.82 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.57 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0183  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.2 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.475928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0947  ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.99 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  30.08 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  33.64 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  32.37 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.91 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.54 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.33 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  32.37 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  32.37 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  33.61 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  32.37 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  32.37 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  30 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.03 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2407  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>