265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1995 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  100 
 
 
168 aa  341  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  97.62 
 
 
197 aa  336  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  80.36 
 
 
174 aa  291  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  44.44 
 
 
174 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  53.09 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  51.19 
 
 
165 aa  157  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  54.44 
 
 
168 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  51.46 
 
 
174 aa  153  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  50.89 
 
 
168 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  46.3 
 
 
162 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  48.52 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  50.3 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  47.5 
 
 
173 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  47.5 
 
 
171 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  46.43 
 
 
174 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  50.91 
 
 
165 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  50.91 
 
 
165 aa  148  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  48.82 
 
 
174 aa  147  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  48.19 
 
 
189 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  50.6 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  47.37 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  48.77 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  49.7 
 
 
165 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  49.7 
 
 
165 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  48.77 
 
 
174 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  46.99 
 
 
196 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  49.7 
 
 
167 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  46.94 
 
 
169 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  46.47 
 
 
179 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  47.62 
 
 
168 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  48.67 
 
 
177 aa  141  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  45.78 
 
 
169 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  42.51 
 
 
168 aa  140  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  45.18 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  47.83 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  45.73 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  46.67 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  45.78 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  45.78 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  45.34 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  44.58 
 
 
169 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  48.26 
 
 
177 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  45.78 
 
 
205 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  45.18 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  45.18 
 
 
183 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  46.06 
 
 
177 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  41.92 
 
 
171 aa  137  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  45.24 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  45.06 
 
 
171 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  45.24 
 
 
185 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  48.84 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  43.37 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  43.37 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  43.37 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  46.39 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  42.17 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  44.05 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  47.83 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  39.05 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  42.17 
 
 
221 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  52.41 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  40.24 
 
 
205 aa  130  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  47.2 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  43.37 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  47.2 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  42.94 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  45.89 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  46.88 
 
 
197 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  46.58 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  42.07 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.87 
 
 
170 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  39.11 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  41.62 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  41.62 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  44.52 
 
 
176 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  41.48 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.18 
 
 
169 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  42.17 
 
 
220 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  45.4 
 
 
164 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  38.25 
 
 
198 aa  122  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  38.95 
 
 
188 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  40.78 
 
 
182 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.55 
 
 
172 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  40.37 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  38.42 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  40.22 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  40.22 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  40.82 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  37.57 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.16 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  38.37 
 
 
185 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  43.87 
 
 
166 aa  117  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  44.85 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  40.12 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  37.02 
 
 
191 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  37.79 
 
 
185 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  37.79 
 
 
194 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  37.79 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  40.41 
 
 
187 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  43.03 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>