211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0798 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  100 
 
 
438 aa  905    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  63.26 
 
 
427 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  51.62 
 
 
461 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  49.55 
 
 
471 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  50.23 
 
 
427 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  48.97 
 
 
427 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  48.51 
 
 
481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  49.44 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  47.76 
 
 
452 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  48.4 
 
 
464 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  46.53 
 
 
477 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  47.83 
 
 
443 aa  378  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  46.47 
 
 
465 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  46.44 
 
 
459 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  42.28 
 
 
459 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  46.7 
 
 
465 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  42.06 
 
 
459 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  42.86 
 
 
435 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  43.21 
 
 
422 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  42.03 
 
 
459 aa  329  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  33.99 
 
 
408 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  31.11 
 
 
436 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  48.17 
 
 
299 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  33.82 
 
 
422 aa  156  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  37.29 
 
 
234 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  36.86 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  36.44 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  35.71 
 
 
199 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  53.06 
 
 
170 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  42.37 
 
 
170 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  35.16 
 
 
166 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 
168 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  33.72 
 
 
168 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  35.63 
 
 
168 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  39.24 
 
 
174 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  48.98 
 
 
172 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  38.81 
 
 
174 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  48.98 
 
 
171 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  36.78 
 
 
174 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  44.64 
 
 
80 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  44.64 
 
 
80 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  41.18 
 
 
354 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  46.94 
 
 
168 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  45.1 
 
 
189 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  40 
 
 
185 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  37.31 
 
 
165 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40 
 
 
185 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  30.4 
 
 
186 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  44.64 
 
 
173 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  41.07 
 
 
165 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  36.36 
 
 
1138 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  28.89 
 
 
169 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  38.57 
 
 
187 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  38.98 
 
 
184 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  28.93 
 
 
222 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  41.07 
 
 
174 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  40 
 
 
185 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  48.08 
 
 
167 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  43.1 
 
 
170 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  41.67 
 
 
160 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  41.07 
 
 
168 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  38.81 
 
 
81 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  43.75 
 
 
189 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  43.08 
 
 
151 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  42.86 
 
 
165 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  42.86 
 
 
165 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  38.46 
 
 
178 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  39.29 
 
 
165 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  39.68 
 
 
172 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  42.86 
 
 
142 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  43.86 
 
 
166 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  41.18 
 
 
167 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  37.33 
 
 
188 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  48 
 
 
185 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  40.35 
 
 
166 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  65.71 
 
 
143 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  43.14 
 
 
171 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  46 
 
 
127 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  37.5 
 
 
165 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  45.83 
 
 
146 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  32.81 
 
 
81 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  38.57 
 
 
321 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  39.66 
 
 
181 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  44 
 
 
189 aa  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  29 
 
 
181 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  34.21 
 
 
198 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  34.21 
 
 
204 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  40.38 
 
 
193 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  34.21 
 
 
198 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2010  HNH endonuclease  42.11 
 
 
118 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  40.82 
 
 
169 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  40 
 
 
197 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  40 
 
 
168 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  43.75 
 
 
185 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  29.13 
 
 
221 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  37.5 
 
 
177 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  23.95 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  42.37 
 
 
191 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  35.06 
 
 
183 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>