281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23331 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  80.92 
 
 
174 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  77.46 
 
 
174 aa  279  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  71.08 
 
 
168 aa  267  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  71.08 
 
 
185 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  68.42 
 
 
187 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  69.88 
 
 
168 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  69.28 
 
 
168 aa  259  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  69.88 
 
 
185 aa  254  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  69.88 
 
 
185 aa  254  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  66.67 
 
 
165 aa  241  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  64.85 
 
 
165 aa  240  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  64.85 
 
 
165 aa  239  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  65.45 
 
 
165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  64.85 
 
 
167 aa  234  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  61.82 
 
 
168 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  61.82 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  61.82 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  45.18 
 
 
171 aa  154  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  47.56 
 
 
177 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  48.28 
 
 
197 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  43.53 
 
 
172 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  46.39 
 
 
168 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  43.21 
 
 
174 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  43.37 
 
 
170 aa  147  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  48.19 
 
 
168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  43.37 
 
 
170 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  47.09 
 
 
174 aa  144  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  48.19 
 
 
189 aa  144  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  45.45 
 
 
166 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  46.99 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  46.26 
 
 
173 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  42.77 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  44.97 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  43.56 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  44.17 
 
 
177 aa  131  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  46.81 
 
 
174 aa  131  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  43.59 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  43.57 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  41.21 
 
 
213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  41.72 
 
 
176 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  37.57 
 
 
204 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  40.94 
 
 
183 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  46.43 
 
 
162 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  45.77 
 
 
222 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  47.26 
 
 
188 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  36.67 
 
 
197 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  44.44 
 
 
169 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  44.97 
 
 
220 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  44.05 
 
 
173 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  42.22 
 
 
180 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  36.46 
 
 
198 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  36.46 
 
 
198 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  46.85 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  45.83 
 
 
169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  39.44 
 
 
182 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  44.68 
 
 
166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  46.48 
 
 
184 aa  118  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  43.36 
 
 
160 aa  118  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  46.15 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  39.11 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  44.44 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  43.45 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  43.45 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  44.83 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  39.11 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  43.45 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  36.14 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  38.98 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  42.26 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  47.29 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  35.36 
 
 
198 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  45.89 
 
 
188 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  44 
 
 
177 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  42.95 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  42.36 
 
 
166 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  40 
 
 
182 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  38.5 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  40 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  43.45 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  40 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  46.88 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  47.48 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  44.44 
 
 
196 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  41.67 
 
 
166 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  40.56 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  42.58 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  38.51 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  38.1 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  38.1 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  41.38 
 
 
220 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  37.1 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  38.69 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  38.51 
 
 
186 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  43.36 
 
 
185 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  38.89 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  37.43 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  39.66 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  41.67 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  36.47 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>