142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0313 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  100 
 
 		 354 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  42.32 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  26.99 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  30.36 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  32.57 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  33.12 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  32.88 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  28.87 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  28.72 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  28.72 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  28.57 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  27.07 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  47.17 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  27.01 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  28.78 
 
 		 459 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  29.46 
 
 		 464 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  41.79 
 
 		 454 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 481 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  51.02 
 
 		 166 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 185 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 477 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  49.06 
 
 		 136 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  27.27 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  46.81 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.98 
 
 		 133 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  48.94 
 
 		 133 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  51.02 
 
 		 160 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  48.08 
 
 		 136 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 452 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  42 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  35 
 
 		 1395 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 185 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1061  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 118 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  27.08 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.62 
 
 		 135 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 170 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  40 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  48.08 
 
 		 199 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 152 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  50 
 
 		 133 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  40.38 
 
 		 165 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  37.66 
 
 		 204 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  37.66 
 
 		 186 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  37.18 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  30.26 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  40 
 
 		 465 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 236 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.25 
 
 		 168 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 102 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 194 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 585 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 221 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  40 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 174 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 185 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0839  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.126251  hitchhiker  0.00000000857836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 146 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 461 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  41.18 
 
 		 185 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  50 
 
 		 200 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2304  hypothetical protein  27.93 
 
 		 381 aa  46.2  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  44.44 
 
 		 184 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.29 
 
 		 168 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  36.07 
 
 		 136 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  32.84 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 198 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  37.25 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  37.93 
 
 		 1003 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  31.82 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 193 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  38 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  50 
 
 		 1064 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1015  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  45.65 
 
 		 133 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  37.04 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 173 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  35.29 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 92 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 171 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  39.62 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  43.48 
 
 		 133 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>