147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1893 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 
435 aa  881    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  79.75 
 
 
422 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  62.88 
 
 
459 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  55.33 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  55.99 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  54.82 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  54.44 
 
 
452 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  55.35 
 
 
477 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  54.02 
 
 
454 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  53.5 
 
 
465 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  50.34 
 
 
459 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  53.04 
 
 
465 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  48.71 
 
 
461 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  46.6 
 
 
427 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  47.67 
 
 
427 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  48.48 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  42.86 
 
 
438 aa  352  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  47.1 
 
 
459 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  45.98 
 
 
459 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  44.29 
 
 
443 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  34.17 
 
 
408 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  30.5 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  48.69 
 
 
299 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  32.21 
 
 
422 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  33.65 
 
 
387 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  36.51 
 
 
234 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  33.33 
 
 
388 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  27.46 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  27.46 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  52.73 
 
 
174 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  48.53 
 
 
168 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  42.65 
 
 
168 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.07 
 
 
168 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  47.06 
 
 
185 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  58.33 
 
 
172 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  45.59 
 
 
185 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  44.07 
 
 
165 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  50.98 
 
 
189 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  44.07 
 
 
165 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  49.23 
 
 
166 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  47.46 
 
 
174 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  45.59 
 
 
185 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  42.65 
 
 
187 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  44.29 
 
 
166 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  47.46 
 
 
165 aa  53.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  41.1 
 
 
166 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  45.76 
 
 
165 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  54.17 
 
 
170 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  49.02 
 
 
167 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  32.41 
 
 
199 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  45.76 
 
 
173 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  46.15 
 
 
170 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  50 
 
 
182 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  47.46 
 
 
184 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  48.98 
 
 
168 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  44.12 
 
 
168 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  44.44 
 
 
122 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  43.64 
 
 
80 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  43.64 
 
 
80 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  51.85 
 
 
187 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  42 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  51.92 
 
 
183 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  44 
 
 
197 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  42.65 
 
 
165 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  51.92 
 
 
183 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  44 
 
 
198 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  44 
 
 
198 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  42.65 
 
 
165 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  45.61 
 
 
160 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  44 
 
 
204 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  43.33 
 
 
185 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  53.06 
 
 
189 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  33.33 
 
 
295 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  42.37 
 
 
1138 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40 
 
 
171 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  44.07 
 
 
174 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  40 
 
 
185 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.64 
 
 
81 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  37.1 
 
 
552 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  50 
 
 
182 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  50 
 
 
182 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  50.98 
 
 
182 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  38.71 
 
 
315 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  48.21 
 
 
175 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  48 
 
 
198 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  50 
 
 
196 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  37.68 
 
 
164 aa  47  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  50 
 
 
171 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  42.65 
 
 
196 aa  47  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  36.51 
 
 
102 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  36 
 
 
292 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.94 
 
 
113 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  46.43 
 
 
186 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  43.14 
 
 
193 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  38.46 
 
 
213 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  36 
 
 
292 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  36 
 
 
292 aa  47  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  37.04 
 
 
131 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  42 
 
 
142 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  46.94 
 
 
185 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>