110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2301 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1495  HNH endonuclease  37.28 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  31.45 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  30.4 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  30.08 
 
 		 459 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  48.89 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  29.27 
 
 		 459 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  38.96 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  33.77 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  37.33 
 
 		 454 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  26.83 
 
 		 427 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  33 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  42 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 452 aa  48.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  42 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  47.83 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  50 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  47.73 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 459 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  44.23 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  42 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  42 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 477 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  50 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  45.45 
 
 		 471 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  44 
 
 		 459 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  31.17 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  31.17 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  46 
 
 		 422 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  37.7 
 
 		 136 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  41.3 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  43.48 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  43.18 
 
 		 189 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  36.67 
 
 		 138 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  45.65 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 465 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 465 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  32.39 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.7 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  44.68 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  39.74 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  42.37 
 
 		 435 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  33.85 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 1138 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  48.72 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  41.3 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  44.68 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  34.21 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  45.24 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  40 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  42.55 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  45.24 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 471 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 471 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  35.29 
 
 		 96 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  33.87 
 
 		 461 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  42.55 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 552 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 191 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 185 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 427 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 181 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  46.67 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  40.91 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>