184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1023 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  78.08 
 
 		 471 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 		 454 aa  937    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  64.63 
 
 		 452 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  65.98 
 
 		 481 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  61.36 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  64.19 
 
 		 465 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  59.87 
 
 		 477 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  63.26 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  61.65 
 
 		 459 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  53.46 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  54.25 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  50.23 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  49.44 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  54.82 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  50.23 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  53.71 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  47.65 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  47.22 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  46.35 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  49.66 
 
 		 459 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  67.89 
 
 		 299 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  33.23 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  30.02 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  31.71 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 234 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  34.19 
 
 		 199 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  42.25 
 
 		 174 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  47.46 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  34.02 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  32.99 
 
 		 168 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  34.02 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  50 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  53.33 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  41.11 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  33.98 
 
 		 131 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  32.99 
 
 		 185 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 185 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 168 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  41.43 
 
 		 165 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 165 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  44.07 
 
 		 165 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 170 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 165 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  47.46 
 
 		 166 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 187 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  41.79 
 
 		 354 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 165 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 173 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 183 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 183 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  32.99 
 
 		 185 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 182 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  48.94 
 
 		 160 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 182 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  40 
 
 		 149 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  48.98 
 
 		 168 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.63 
 
 		 133 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  42.67 
 
 		 182 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  40 
 
 		 164 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 167 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 174 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 166 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  43.33 
 
 		 184 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 200 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 171 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.66 
 
 		 113 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 81 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  52.08 
 
 		 189 aa  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 188 aa  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.66 
 
 		 113 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 187 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  40 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  40 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  40 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  37.66 
 
 		 113 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  37.33 
 
 		 186 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  24.72 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  36.36 
 
 		 136 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  50 
 
 		 185 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  24.72 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  45 
 
 		 1138 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  40 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  43.33 
 
 		 122 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 80 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 80 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  37.66 
 
 		 136 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  35.71 
 
 		 113 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 182 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  40 
 
 		 166 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  50 
 
 		 198 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 186 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 185 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  26.02 
 
 		 222 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>