148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10571 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  100 
 
 
113 aa  237  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  85.71 
 
 
113 aa  206  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  85.84 
 
 
113 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  84.96 
 
 
113 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  63.96 
 
 
131 aa  173  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  64.86 
 
 
136 aa  168  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  63.06 
 
 
135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  63.96 
 
 
136 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  63.06 
 
 
136 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  61.95 
 
 
133 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  61.06 
 
 
133 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  61.06 
 
 
133 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  61.06 
 
 
133 aa  156  8e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  60.18 
 
 
133 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  41.43 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  37.8 
 
 
200 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  37.36 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  41.43 
 
 
169 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  56.1 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  44.23 
 
 
183 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  44.23 
 
 
196 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  38.57 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  38.57 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  42.31 
 
 
205 aa  53.9  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  41.38 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  38.46 
 
 
198 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  51.22 
 
 
199 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  44.23 
 
 
220 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  51.22 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  33 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  37.18 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  41.79 
 
 
315 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  40 
 
 
184 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  46.94 
 
 
173 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  40.38 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  40.38 
 
 
166 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  48.78 
 
 
165 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  40.38 
 
 
220 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  34.62 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  40.38 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  40.38 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  40.38 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  42.31 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  33.33 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  37.66 
 
 
454 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  46.94 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  36.67 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  40.32 
 
 
236 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  43.48 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  40.35 
 
 
422 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  38.03 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  45.1 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  38.46 
 
 
221 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  35.94 
 
 
435 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  46.94 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  43.4 
 
 
191 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  49.09 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  42.22 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  36.21 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  33.73 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  40.35 
 
 
471 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  45 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  46.34 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  42.86 
 
 
205 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  34.18 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  42.22 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  32.84 
 
 
1138 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  31.46 
 
 
452 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  38.57 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  46.34 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  38.1 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  42.22 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  37.25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  42.22 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  34.92 
 
 
204 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  42.59 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  38.71 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  46.67 
 
 
189 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.04 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.1 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  36.21 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  50 
 
 
213 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  40 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  40.74 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  32.39 
 
 
459 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  38.3 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  38.18 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  40 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  30.95 
 
 
185 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  34.92 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  34.92 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  34.38 
 
 
181 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  35.09 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  37.74 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  39.62 
 
 
481 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  47.73 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  36.07 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38.89 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  43.4 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>