286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0613 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  100 
 
 		 185 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  94.59 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  91.35 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  93.51 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  92.97 
 
 		 191 aa  361  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  90.27 
 
 		 185 aa  360  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  90.27 
 
 		 185 aa  360  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  76.76 
 
 		 196 aa  310  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  74.05 
 
 		 185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  76.63 
 
 		 189 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  75.14 
 
 		 185 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  74.59 
 
 		 185 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  76.8 
 
 		 189 aa  296  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  74.59 
 
 		 216 aa  295  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  71.89 
 
 		 185 aa  294  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  74.03 
 
 		 190 aa  292  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  76 
 
 		 186 aa  291  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  74.59 
 
 		 190 aa  291  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  73.48 
 
 		 190 aa  290  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  67.05 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  66.67 
 
 		 188 aa  257  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  66.09 
 
 		 211 aa  255  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  65.73 
 
 		 186 aa  254  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  65.52 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  64.94 
 
 		 198 aa  248  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  61.62 
 
 		 187 aa  247  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  65.14 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  63.22 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  65.14 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  65.52 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  63.39 
 
 		 186 aa  239  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  61.24 
 
 		 188 aa  240  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  65.9 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  61.36 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  61.36 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  60.8 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  58.52 
 
 		 183 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  57.95 
 
 		 183 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  57.06 
 
 		 178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  57.95 
 
 		 182 aa  210  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  60.14 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  50.38 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  50 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  42.78 
 
 		 174 aa  131  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  42.94 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  42.6 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  42.66 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  44.06 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 165 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  42.36 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  41.96 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  38.12 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  37.57 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  37.71 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.71 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  38.95 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  39.55 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  43.75 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  42.66 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  39.58 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  41.03 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  38.96 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  43.36 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  34.5 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  33.66 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  37.29 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  35.63 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  34.86 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  36.9 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  37.1 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  39.6 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.93 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  37.66 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  39.08 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  38.06 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  40.4 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  40.82 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  39.01 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  40.88 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  40.14 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  37.76 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  39.16 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  35.43 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  36.55 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>