147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2932 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  100 
 
 		 104 aa  220  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  48.72 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  41.3 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  46.25 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  54.84 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  46.15 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  47.22 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  46.15 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  39.33 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  48.08 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  48.08 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  42 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  45.1 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  50 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  56.52 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  46.51 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  44.26 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  46.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  44.19 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  45.1 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  41.67 
 
 		 187 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  50.98 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  40.74 
 
 		 471 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  47.83 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  44.19 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  41.86 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  45.65 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  43.18 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  50 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 427 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  50 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  50 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  44.44 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  35.16 
 
 		 459 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  41.27 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  47.92 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  39.34 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  25.24 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  37.29 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  37.29 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  37.29 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  34.07 
 
 		 459 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  37.29 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 205 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  32.97 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  32.97 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  32.94 
 
 		 1187 aa  43.5  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  33.87 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  39.58 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  42.37 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  41.86 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  37.7 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 202 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  46.15 
 
 		 422 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  45.65 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.22 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  44.68 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  39.58 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>