237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0868 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  100 
 
 
165 aa  342  8.999999999999999e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  43.4 
 
 
160 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  43.97 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  43.36 
 
 
148 aa  94.4  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  40.14 
 
 
173 aa  94  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  41.43 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  41.84 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  42.45 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  38.73 
 
 
174 aa  92  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  36.88 
 
 
184 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  40 
 
 
189 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  35.71 
 
 
222 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  36.88 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  38.03 
 
 
205 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  39.16 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  38.55 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  41.73 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  34.62 
 
 
220 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  36.69 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  40.58 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  35.71 
 
 
222 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  35.71 
 
 
222 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  35.71 
 
 
222 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  33.57 
 
 
221 aa  84  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  41.41 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  37.24 
 
 
146 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  38.67 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  37.59 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  40.41 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  37.59 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  33.57 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  35.97 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  34.72 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  40.58 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  38.46 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  35.47 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  38.46 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  35.17 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  36.76 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  35.46 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  41.96 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  34.78 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.88 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  34.93 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  35.46 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  42.42 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  36.55 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  37.06 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  33.33 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  34.75 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  32.62 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  36.96 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  33.79 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  40.38 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  33.79 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  39.42 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  39.42 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  40.4 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  35.81 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  30.5 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  32.12 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  35.48 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  36.96 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  38.46 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  35.42 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  38.83 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  34.27 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  34.27 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.3 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  53.42 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  39.05 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  34.51 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  33.33 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  38.46 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  34.06 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  32.41 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  32.64 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  31.94 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  47.95 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  39.39 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  31.91 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  49.28 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  41.84 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  42.73 
 
 
182 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  41.84 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  42.73 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  42.73 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  41.51 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  31.21 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  47.83 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  33.65 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  32.87 
 
 
189 aa  70.5  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  31.25 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  34.01 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  29.68 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  40.95 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  40.95 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  28.57 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>