19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1902 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  100 
 
 		 1187 aa  2470    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  31.59 
 
 		 1138 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  24 
 
 		 1064 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1066 aa  78.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  21.46 
 
 		 1003 aa  73.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  20.39 
 
 		 1259 aa  66.2  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  20.45 
 
 		 1021 aa  65.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1166 aa  65.1  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  21.95 
 
 		 1195 aa  54.3  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  20.87 
 
 		 1037 aa  53.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.86 
 
 		 984 aa  52.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 552 aa  49.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  27.83 
 
 		 1121 aa  48.5  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.38 
 
 		 1068 aa  48.5  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1129  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 271 aa  48.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497129  unclonable  0.00000789585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1064 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0084  restriction endonuclease  25.48 
 
 		 309 aa  47  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  22.65 
 
 		 1079 aa  46.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 205 aa  45.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>