25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0342 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  45.23 
 
 		 1066 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  44.82 
 
 		 1064 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  100 
 
 		 1003 aa  2047    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  31.03 
 
 		 1021 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  30.32 
 
 		 1131 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.99 
 
 		 984 aa  281  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.55 
 
 		 1037 aa  210  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  29.06 
 
 		 1079 aa  207  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.6 
 
 		 1259 aa  187  9e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1064 aa  181  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  26.14 
 
 		 1121 aa  171  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.75 
 
 		 1068 aa  168  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1166 aa  167  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.86 
 
 		 1426 aa  124  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.06 
 
 		 1195 aa  108  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.58 
 
 		 1173 aa  92.8  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  20.92 
 
 		 1187 aa  86.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  23.33 
 
 		 1138 aa  76.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1370 aa  63.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.26 
 
 		 1395 aa  63.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  23.71 
 
 		 1388 aa  53.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  26.25 
 
 		 641 aa  47  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 459 aa  47  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 459 aa  46.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 354 aa  45.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>