22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1029 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  82.65 
 
 		 1066 aa  1798    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 		 1064 aa  2173    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  44.82 
 
 		 1003 aa  788    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  31.07 
 
 		 1021 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  29.52 
 
 		 1131 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.93 
 
 		 984 aa  268  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.95 
 
 		 1259 aa  209  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.93 
 
 		 1037 aa  204  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  25.7 
 
 		 1121 aa  187  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  27 
 
 		 1079 aa  174  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1166 aa  154  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.9 
 
 		 1068 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1064 aa  146  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.2 
 
 		 1426 aa  127  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.85 
 
 		 1173 aa  103  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  23.89 
 
 		 1187 aa  79.3  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.07 
 
 		 1195 aa  75.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  21.97 
 
 		 1138 aa  73.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.94 
 
 		 1395 aa  70.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  26.45 
 
 		 1388 aa  57.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1370 aa  52.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  50 
 
 		 354 aa  45.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>