22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1875 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 		 984 aa  1982    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  34.74 
 
 		 1021 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  29.65 
 
 		 1131 aa  302  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1066 aa  281  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.07 
 
 		 1003 aa  274  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.87 
 
 		 1064 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1064 aa  226  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  26.17 
 
 		 1079 aa  220  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.79 
 
 		 1037 aa  205  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.96 
 
 		 1259 aa  201  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1166 aa  201  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  27.94 
 
 		 1121 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.06 
 
 		 1068 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25 
 
 		 1195 aa  150  9e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.98 
 
 		 1426 aa  117  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.89 
 
 		 1173 aa  96.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  23.53 
 
 		 1138 aa  80.5  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  23.72 
 
 		 641 aa  73.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.24 
 
 		 1395 aa  55.5  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1370 aa  53.5  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  21.86 
 
 		 1187 aa  52  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  23.61 
 
 		 1388 aa  45.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>