22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0099 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  100 
 
 		 1037 aa  2132    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  28.66 
 
 		 1079 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1166 aa  298  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.59 
 
 		 1068 aa  276  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1064 aa  261  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.33 
 
 		 1021 aa  221  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.14 
 
 		 1064 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.55 
 
 		 1003 aa  203  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.94 
 
 		 1131 aa  201  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1066 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.79 
 
 		 984 aa  179  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  24.57 
 
 		 1121 aa  163  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.22 
 
 		 1426 aa  145  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.61 
 
 		 1173 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.63 
 
 		 1195 aa  137  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.42 
 
 		 1259 aa  127  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  23.27 
 
 		 1138 aa  91.3  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  25.32 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  24.56 
 
 		 1388 aa  56.2  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.77 
 
 		 1395 aa  55.1  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  20.87 
 
 		 1187 aa  54.7  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1370 aa  49.3  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>