22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0400 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  100 
 
 		 1079 aa  2198    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1166 aa  618  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  37.64 
 
 		 1064 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  37.16 
 
 		 1068 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  28.66 
 
 		 1037 aa  311  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  29.15 
 
 		 1173 aa  249  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.46 
 
 		 1195 aa  230  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  29.06 
 
 		 1003 aa  203  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.91 
 
 		 1021 aa  199  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  36.67 
 
 		 641 aa  197  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.21 
 
 		 1064 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.9 
 
 		 984 aa  178  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1066 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.9 
 
 		 1131 aa  148  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  22.98 
 
 		 1121 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  22.51 
 
 		 1259 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.4 
 
 		 1426 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  23.75 
 
 		 1138 aa  59.3  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.65 
 
 		 1395 aa  54.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  23.38 
 
 		 1388 aa  49.3  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1370 aa  47.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  22.65 
 
 		 1187 aa  45.8  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>