132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1951 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  100 
 
 
1138 aa  2294    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  31.68 
 
 
1187 aa  438  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.27 
 
 
1037 aa  91.3  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.47 
 
 
984 aa  81.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.97 
 
 
1064 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  25.7 
 
 
1166 aa  73.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  22.48 
 
 
1066 aa  71.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  21.65 
 
 
1021 aa  70.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.33 
 
 
1003 aa  62  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  24.14 
 
 
1079 aa  59.7  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  21.59 
 
 
1426 aa  59.7  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  22.95 
 
 
1068 aa  58.5  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  24.7 
 
 
1195 aa  58.2  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.16 
 
 
1131 aa  58.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  43.28 
 
 
459 aa  57.4  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  43.28 
 
 
459 aa  57.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  47.54 
 
 
427 aa  57.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  46.15 
 
 
471 aa  57.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  43.55 
 
 
292 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  43.55 
 
 
295 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  43.55 
 
 
292 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  43.55 
 
 
292 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.82 
 
 
1259 aa  57  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  25.17 
 
 
1064 aa  55.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  36.36 
 
 
438 aa  55.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  39.66 
 
 
443 aa  55.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.25 
 
 
1395 aa  54.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  30.84 
 
 
174 aa  53.5  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  44.07 
 
 
459 aa  53.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  39.71 
 
 
197 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  46.67 
 
 
422 aa  53.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0084  restriction endonuclease  26.72 
 
 
309 aa  52.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  41.94 
 
 
170 aa  52.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  22.25 
 
 
1121 aa  52  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  31.48 
 
 
174 aa  51.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  46.67 
 
 
185 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  50 
 
 
166 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  46.67 
 
 
185 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  46.67 
 
 
185 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  45.65 
 
 
213 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  40 
 
 
477 aa  50.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  41.18 
 
 
172 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  45 
 
 
461 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  50 
 
 
211 aa  49.7  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  44.44 
 
 
185 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  45.65 
 
 
204 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  32.05 
 
 
186 aa  49.3  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  45.65 
 
 
198 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  45.65 
 
 
198 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  42.86 
 
 
171 aa  48.9  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  42.86 
 
 
173 aa  48.9  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  37.29 
 
 
205 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.59 
 
 
1173 aa  48.9  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.6 
 
 
171 aa  48.9  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  45 
 
 
454 aa  48.9  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  44.26 
 
 
146 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  36.92 
 
 
427 aa  48.5  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  42.37 
 
 
435 aa  48.5  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  36.76 
 
 
198 aa  48.5  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  38.46 
 
 
452 aa  48.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  32.1 
 
 
465 aa  48.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  43.48 
 
 
189 aa  48.1  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  40.68 
 
 
459 aa  48.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  28.85 
 
 
164 aa  47.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  39.13 
 
 
187 aa  47.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  41.3 
 
 
205 aa  48.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  41.3 
 
 
189 aa  48.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  43.48 
 
 
197 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  40.35 
 
 
169 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2010  HNH endonuclease  43.64 
 
 
118 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  44.68 
 
 
169 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  40.91 
 
 
190 aa  46.6  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  42.37 
 
 
165 aa  47.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  37.1 
 
 
189 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  41.67 
 
 
194 aa  47  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  36.21 
 
 
174 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  38.18 
 
 
81 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  36.36 
 
 
464 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  38.71 
 
 
481 aa  47  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  44.83 
 
 
148 aa  47  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  41.3 
 
 
178 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  40.91 
 
 
190 aa  47  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  27.78 
 
 
236 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  43.48 
 
 
168 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  41.3 
 
 
184 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  40.91 
 
 
162 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  37.1 
 
 
427 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  36.36 
 
 
465 aa  46.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  43.48 
 
 
188 aa  46.2  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  30.56 
 
 
168 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  39.13 
 
 
186 aa  46.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  36.96 
 
 
216 aa  46.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  40.68 
 
 
168 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  44.9 
 
 
186 aa  46.2  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  43.48 
 
 
189 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  31.68 
 
 
192 aa  46.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  36.84 
 
 
169 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  41.3 
 
 
189 aa  46.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  37.29 
 
 
169 aa  46.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2805  hypothetical protein  34.43 
 
 
234 aa  45.8  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.4769199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>