20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0060 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  100 
 
 		 1131 aa  2329    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  33.13 
 
 		 1021 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  30.32 
 
 		 1003 aa  355  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1066 aa  352  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.52 
 
 		 1064 aa  348  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.22 
 
 		 984 aa  308  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.94 
 
 		 1037 aa  200  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.8 
 
 		 1068 aa  186  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.88 
 
 		 1259 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  27.33 
 
 		 1121 aa  171  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  24.69 
 
 		 1079 aa  148  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1064 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1166 aa  140  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.43 
 
 		 1173 aa  126  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  24.37 
 
 		 1195 aa  118  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.37 
 
 		 1426 aa  100  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.14 
 
 		 1395 aa  93.2  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  22.57 
 
 		 1388 aa  76.3  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1370 aa  68.6  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  25.16 
 
 		 1138 aa  58.2  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>