24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1230 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  100 
 
 		 1068 aa  2197    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1166 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  37.16 
 
 		 1079 aa  558  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1064 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.68 
 
 		 1037 aa  291  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.4 
 
 		 1021 aa  227  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  29.53 
 
 		 1173 aa  211  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.84 
 
 		 1195 aa  200  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  35.82 
 
 		 641 aa  196  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.73 
 
 		 984 aa  196  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.01 
 
 		 1131 aa  193  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.37 
 
 		 1003 aa  166  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.9 
 
 		 1064 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1066 aa  136  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.58 
 
 		 1426 aa  125  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  29.31 
 
 		 1121 aa  108  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  28.52 
 
 		 1259 aa  104  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.62 
 
 		 1395 aa  62.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  22.95 
 
 		 1138 aa  57.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1370 aa  56.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  23.4 
 
 		 1388 aa  51.6  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  23.38 
 
 		 1187 aa  48.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  26.04 
 
 		 459 aa  45.8  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 649 aa  45.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>