23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3120 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  100 
 
 		 1021 aa  2109    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  33.13 
 
 		 1131 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.07 
 
 		 1064 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1066 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.73 
 
 		 984 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  30.93 
 
 		 1003 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1166 aa  234  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  24.33 
 
 		 1037 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.81 
 
 		 1259 aa  218  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  26.4 
 
 		 1068 aa  217  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  29.62 
 
 		 1121 aa  212  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  25.82 
 
 		 1079 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  24.05 
 
 		 1195 aa  151  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.49 
 
 		 1173 aa  110  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.86 
 
 		 1426 aa  98.6  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.06 
 
 		 1395 aa  83.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  23.91 
 
 		 641 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1370 aa  72  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  21.27 
 
 		 1138 aa  69.3  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  20.45 
 
 		 1187 aa  67  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  25.45 
 
 		 1388 aa  65.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  29.31 
 
 		 189 aa  45.4  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>