41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0453 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  100 
 
 		 1173 aa  2336    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1166 aa  265  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  28.03 
 
 		 1079 aa  260  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1064 aa  233  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  29.67 
 
 		 1068 aa  221  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.94 
 
 		 1195 aa  192  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.71 
 
 		 1037 aa  150  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.79 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.91 
 
 		 1064 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.25 
 
 		 1021 aa  125  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1066 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.71 
 
 		 984 aa  109  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.11 
 
 		 1003 aa  102  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  21.21 
 
 		 1259 aa  100  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  22.14 
 
 		 1121 aa  70.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.9 
 
 		 1426 aa  69.3  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  30.93 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  24.49 
 
 		 1138 aa  66.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  22.91 
 
 		 1187 aa  64.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.81 
 
 		 1395 aa  59.7  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  32.38 
 
 		 164 aa  52.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  43.24 
 
 		 177 aa  48.5  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  43.24 
 
 		 177 aa  48.5  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  40.3 
 
 		 168 aa  48.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 146 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 213 aa  48.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 204 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1048  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 211 aa  47.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 165 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 166 aa  46.2  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 172 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 198 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  32.89 
 
 		 197 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 198 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  35 
 
 		 222 aa  46.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  31.43 
 
 		 1388 aa  45.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1370 aa  45.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 169 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  37.33 
 
 		 197 aa  45.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 165 aa  45.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  39.34 
 
 		 174 aa  45.1  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>