23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4054 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  100 
 
 		 1166 aa  2390    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  48.38 
 
 		 1064 aa  927    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  80.05 
 
 		 641 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  36.56 
 
 		 1079 aa  588  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  35.94 
 
 		 1068 aa  549  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.78 
 
 		 1037 aa  284  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.21 
 
 		 1195 aa  241  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.97 
 
 		 1021 aa  212  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.23 
 
 		 1173 aa  194  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.52 
 
 		 984 aa  187  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0956  hypothetical protein  83.72 
 
 		 94 aa  155  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.34 
 
 		 1064 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1066 aa  148  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.9 
 
 		 1003 aa  139  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.28 
 
 		 1131 aa  132  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.61 
 
 		 1426 aa  129  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  25.58 
 
 		 1121 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.84 
 
 		 1259 aa  89  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  25.7 
 
 		 1138 aa  73.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.9 
 
 		 1395 aa  59.3  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  25.44 
 
 		 1388 aa  59.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1370 aa  51.6  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  20.43 
 
 		 1187 aa  51.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>