28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0327 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 
1395 aa  2839    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  35.79 
 
 
1388 aa  490  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0894  hypothetical protein  32.02 
 
 
1370 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.14 
 
 
1131 aa  92.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  28.41 
 
 
1021 aa  83.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  29.03 
 
 
1121 aa  82.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.94 
 
 
1064 aa  70.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  28.87 
 
 
1003 aa  63.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  20.8 
 
 
1068 aa  62.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  26.59 
 
 
1066 aa  62  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25.88 
 
 
1259 aa  62.4  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  24.01 
 
 
1195 aa  60.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  24.9 
 
 
1166 aa  59.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  22.57 
 
 
1064 aa  55.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  27.81 
 
 
1173 aa  55.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.24 
 
 
984 aa  55.5  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.77 
 
 
1037 aa  55.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  24.65 
 
 
1079 aa  54.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  29.25 
 
 
1138 aa  54.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2248  hypothetical protein  46.81 
 
 
84 aa  51.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.299181  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  35 
 
 
354 aa  48.9  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  29.79 
 
 
102 aa  48.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  28.7 
 
 
459 aa  46.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  37.08 
 
 
374 aa  46.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  38.24 
 
 
131 aa  45.8  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  33.9 
 
 
148 aa  45.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  40.74 
 
 
151 aa  45.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  34.55 
 
 
459 aa  45.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>