21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0243 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  100 
 
 		 1195 aa  2453    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1166 aa  241  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1064 aa  230  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  26.46 
 
 		 1079 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25.61 
 
 		 1068 aa  182  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.38 
 
 		 1173 aa  170  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.64 
 
 		 984 aa  142  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.1 
 
 		 1021 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.54 
 
 		 1037 aa  128  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.25 
 
 		 1131 aa  104  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.16 
 
 		 1003 aa  92.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  26.79 
 
 		 1426 aa  83.2  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1066 aa  81.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  25 
 
 		 1121 aa  80.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.07 
 
 		 1064 aa  75.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  25 
 
 		 1259 aa  73.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.01 
 
 		 1395 aa  60.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  24.7 
 
 		 1138 aa  58.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  21.95 
 
 		 1187 aa  54.3  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2010  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1101 aa  49.7  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.320871  normal  0.091538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  21.9 
 
 		 641 aa  45.8  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>