208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3026 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  100 
 
 		 552 aa  1124    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  44.78 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  44.93 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 170 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  50 
 
 		 177 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  36.36 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  42.03 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  47.46 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  42.03 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 127 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  41.89 
 
 		 178 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  44.12 
 
 		 173 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  43.1 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  42.37 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  45 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  30.69 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  45 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  40.35 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  47.46 
 
 		 165 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 170 aa  57  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 183 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 187 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 166 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 459 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 174 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  31.82 
 
 		 171 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 204 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 459 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 198 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 165 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 198 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 197 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 168 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 194 aa  55.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 165 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 165 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 167 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 177 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 168 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  40 
 
 		 184 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 213 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  37.93 
 
 		 194 aa  54.3  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  47.69 
 
 		 166 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45 
 
 		 197 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  45 
 
 		 168 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  38.6 
 
 		 196 aa  53.9  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  46.43 
 
 		 194 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  38.33 
 
 		 168 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  46.43 
 
 		 194 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 186 aa  53.9  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 81 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.72 
 
 		 165 aa  53.5  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 189 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  40.68 
 
 		 174 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 185 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  46.43 
 
 		 198 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 174 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  41.67 
 
 		 187 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 133 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  40 
 
 		 164 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 186 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  40.35 
 
 		 204 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 185 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 185 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  34.83 
 
 		 169 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 185 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 185 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  42.37 
 
 		 185 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 185 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 176 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 216 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 185 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  48.21 
 
 		 165 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  40 
 
 		 191 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  47.69 
 
 		 166 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 162 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 196 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 169 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 189 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 186 aa  51.6  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 185 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 186 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>