218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1257 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  100 
 
 		 189 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  52.49 
 
 		 196 aa  207  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  53.67 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  53.04 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  55.23 
 
 		 184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  55.23 
 
 		 184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  50.56 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  51.41 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  50 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  49.44 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  50.56 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  48.88 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  47.54 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  46.86 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  50.56 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  46.29 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  44.63 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  46.45 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  45.36 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  45.36 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  44 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  46.89 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  49.15 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  45.95 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  45.76 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  44.32 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  37.97 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  37.97 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  39.46 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 177 aa  97.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  36.47 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  38.69 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  45.92 
 
 		 170 aa  91.7  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  37.33 
 
 		 168 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  55.56 
 
 		 177 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  35.4 
 
 		 174 aa  91.3  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  36.5 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  44.79 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  36 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  36 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  46.46 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  36 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  44.66 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.87 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  34 
 
 		 168 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  51.22 
 
 		 174 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  34 
 
 		 168 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  33.14 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  34.9 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  50 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  35.33 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  48.81 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  46.91 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  48.81 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  35.22 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  34.23 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  48.81 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  34.23 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  50 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  46.91 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  50 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  33.77 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  36.08 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  33.56 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.77 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  33.56 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  46.75 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  33.12 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  37.4 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  35.46 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  40.54 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  40.34 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  32.89 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  34.84 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  33.55 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  36.3 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  46.25 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  35.86 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40.4 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  34.87 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  33.12 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>