240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0934 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  98.39 
 
 
204 aa  379  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  80.43 
 
 
221 aa  313  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  79.35 
 
 
220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  56.82 
 
 
184 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  56.82 
 
 
184 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  51.37 
 
 
185 aa  188  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  54.07 
 
 
181 aa  184  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  50.56 
 
 
189 aa  184  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  49.46 
 
 
194 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  47.85 
 
 
196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  48.09 
 
 
185 aa  180  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  46.49 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  47.54 
 
 
189 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  48.63 
 
 
185 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  47.54 
 
 
189 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  47.03 
 
 
199 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  47.22 
 
 
193 aa  170  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  46.99 
 
 
186 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  46.45 
 
 
185 aa  168  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  45.9 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  46.45 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  45.36 
 
 
185 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  45.9 
 
 
185 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  45.36 
 
 
185 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  46.89 
 
 
193 aa  158  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  45.16 
 
 
202 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  46.89 
 
 
184 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  44.75 
 
 
187 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  42.39 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  43.58 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  39.47 
 
 
174 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  55.56 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  35.76 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  35.4 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  35.76 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  35.4 
 
 
197 aa  94.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  35.62 
 
 
174 aa  94.7  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  37.75 
 
 
168 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  54.17 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  54.17 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  55.56 
 
 
197 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  53.41 
 
 
166 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  38.69 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  38.1 
 
 
185 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.07 
 
 
168 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  38.41 
 
 
177 aa  91.7  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  38.55 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  48.81 
 
 
205 aa  90.9  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  38.82 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  37.5 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  43.37 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  53.16 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  42.02 
 
 
171 aa  88.6  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  53.16 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  53.16 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  50.63 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  36.6 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  37.75 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  50 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  37.4 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  37.75 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  45.26 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  32.88 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  39.6 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  37.09 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  51.72 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  51.22 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  49.37 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  35.85 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  51.22 
 
 
183 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  36.42 
 
 
174 aa  84.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  47 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  40.95 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  37.09 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  46.84 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  51.95 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  50 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  41.3 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  50 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  48.28 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.6 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  43.53 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  44.44 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  51.11 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  48.86 
 
 
162 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  50 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  49.41 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  33.33 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  47.52 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  34.42 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  49.37 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  38.83 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  49.43 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  49.43 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  52.44 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  46.99 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  41.18 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  33.77 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  46.25 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>