More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4021 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  100 
 
 
81 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  72.5 
 
 
80 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  72.5 
 
 
80 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  60 
 
 
81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  59.7 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  44.64 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  38.03 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  47.17 
 
 
184 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  49.23 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  42.59 
 
 
174 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  44.78 
 
 
240 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  42.86 
 
 
221 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  47.46 
 
 
321 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  45.1 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  41.79 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  49.06 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  44.62 
 
 
585 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  36.62 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  48.15 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  44.62 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  42.42 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  32.79 
 
 
552 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  44.44 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  39.06 
 
 
186 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  41.54 
 
 
174 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  37.14 
 
 
179 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  42.11 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  38.33 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  39.39 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  46.3 
 
 
170 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.62 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  44.44 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  43.08 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  42.59 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  44.44 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  41.07 
 
 
443 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  46.3 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  35.38 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  35.48 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  40.74 
 
 
177 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  35.48 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  38.71 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  31.88 
 
 
459 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  42.86 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  38.71 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  41.54 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  38.18 
 
 
459 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  40.68 
 
 
560 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  46.67 
 
 
230 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  41.18 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  33.87 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  38.33 
 
 
177 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  40 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  45 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  40 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  39.22 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  41.38 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  39.22 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  38.81 
 
 
438 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  37.88 
 
 
178 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  42.59 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  39.68 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  37.7 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  41.82 
 
 
427 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  48.21 
 
 
842 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  39.22 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  39.53 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  38.98 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  47.27 
 
 
452 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  37.04 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  33.33 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  41.54 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  39.53 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  38.46 
 
 
165 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  38.46 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  45 
 
 
228 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  40 
 
 
165 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  36.67 
 
 
175 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  40 
 
 
165 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  40.68 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  39.66 
 
 
188 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  41.54 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  38.46 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  38.46 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  35.94 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  41.82 
 
 
471 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  43.33 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  39.22 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  32.26 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  35.94 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  36.92 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  40 
 
 
191 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  32.26 
 
 
204 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  34.48 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  30.3 
 
 
183 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  36.51 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  43.14 
 
 
205 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  42.55 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  38.89 
 
 
213 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  36.67 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>