244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0175 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  100 
 
 
172 aa  361  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  75.88 
 
 
171 aa  280  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  68.24 
 
 
170 aa  263  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  69.41 
 
 
170 aa  257  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  70.24 
 
 
168 aa  257  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  56.02 
 
 
166 aa  206  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  49.09 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  45.96 
 
 
171 aa  170  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  49.09 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  49.09 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  49.7 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  49.09 
 
 
165 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  42.86 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  46.71 
 
 
173 aa  161  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  46.99 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  46.75 
 
 
168 aa  160  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  45.51 
 
 
174 aa  157  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  44.31 
 
 
174 aa  155  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.85 
 
 
168 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.85 
 
 
168 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  44.31 
 
 
165 aa  153  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  43.71 
 
 
174 aa  151  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  46.06 
 
 
168 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  43.37 
 
 
187 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  43.53 
 
 
189 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  43.56 
 
 
177 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  44.24 
 
 
185 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  43.64 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  43.64 
 
 
174 aa  144  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  42.77 
 
 
185 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  43.56 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  45.52 
 
 
174 aa  137  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  45.06 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  38.27 
 
 
162 aa  134  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  43.79 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  42.94 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  42.35 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  42.35 
 
 
185 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  45.52 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  42.35 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  40.56 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  47.69 
 
 
177 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  38.37 
 
 
222 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  41.76 
 
 
185 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  41.76 
 
 
185 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  38.15 
 
 
222 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  38.15 
 
 
222 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  38.15 
 
 
222 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  42.95 
 
 
188 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  44.83 
 
 
185 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  36.9 
 
 
176 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  41.36 
 
 
216 aa  121  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  37.58 
 
 
174 aa  121  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  38.55 
 
 
168 aa  120  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  44.08 
 
 
191 aa  120  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  36.9 
 
 
177 aa  120  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  38.79 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  43.45 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  43.45 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  38.04 
 
 
166 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  38.92 
 
 
220 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  39.52 
 
 
221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  40.24 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  41.04 
 
 
189 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  40.46 
 
 
186 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  36.97 
 
 
176 aa  117  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  40.46 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  39.76 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  40.7 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  36.05 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  40 
 
 
188 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  33.51 
 
 
197 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  38.01 
 
 
166 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  44.06 
 
 
169 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  40.59 
 
 
211 aa  114  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  38.24 
 
 
196 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  41.94 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  42.76 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  39.64 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  37.43 
 
 
198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  44.62 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  42.07 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  39.41 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  36.47 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  34.34 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  40 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  37.13 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  42.76 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  41.29 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  38.24 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  40.33 
 
 
188 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  40 
 
 
186 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  34.25 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  39.53 
 
 
186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  33.33 
 
 
204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  35.98 
 
 
205 aa  111  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  36.42 
 
 
179 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  40.65 
 
 
182 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  40.65 
 
 
182 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  32.8 
 
 
198 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>