More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1583 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  100 
 
 		 166 aa  344  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  53.99 
 
 		 171 aa  210  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  53.61 
 
 		 171 aa  210  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  55.28 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  56.02 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  53.89 
 
 		 170 aa  203  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  48.8 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  51.2 
 
 		 168 aa  191  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  53.42 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  54.04 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  54.22 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  54.22 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  50.6 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  50.6 
 
 		 168 aa  160  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  51.55 
 
 		 189 aa  157  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  48.8 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  49.4 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  43.71 
 
 		 174 aa  153  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  47.62 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  48.19 
 
 		 165 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  46.39 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  49.66 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  48.97 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  48.98 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  47.9 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  43.98 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  48.77 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  42.77 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  50.3 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  45.45 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  45.83 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  47.52 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  46.06 
 
 		 213 aa  140  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  44.91 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  49.66 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  50 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  48.23 
 
 		 185 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  48.97 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  43.53 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  43.11 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.68 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  44.85 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  45.78 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  51.03 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  51.03 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  46.71 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  44.85 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  43.56 
 
 		 205 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  43.79 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  43.79 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  46.53 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  42.6 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  41.32 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  45.7 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  45.06 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  44.17 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  38.73 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  47.31 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  41.46 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.4 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  46.53 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  43.12 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  41.72 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  43.9 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  40.83 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  39.88 
 
 		 189 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  41.1 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  47.22 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  46.43 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  41.32 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  42.68 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  40.49 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  40.49 
 
 		 222 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  40.49 
 
 		 222 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  40.49 
 
 		 222 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  38.15 
 
 		 216 aa  121  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  43.6 
 
 		 187 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 211 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 188 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  47.88 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  42.07 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  40.37 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  42.68 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  41.67 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  42.36 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  45.7 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  40.24 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>